需要帮助实施最佳实践。 操作环境如下:
在测试中,我尝试使用带有glob路径的sc.textFile()从Spark处理160,000个后处理文件,但在驱动程序进程中出现OutOfMemory异常时失败。
处理此类数据的最佳做法是什么? 我应该使用HBase而不是普通文件来保存后处理数据吗?
答案 0 :(得分:9)
我们写了自己的装载机。它通过HDFS中的小文件解决了我们的问题。它使用Hadoop CombineFileInputFormat。 在我们的例子中,它将映射器的数量从100000减少到大约3000,并使工作速度明显加快。
https://github.com/RetailRocket/SparkMultiTool
示例:
import ru.retailrocket.spark.multitool.Loaders
val sessions = Loaders.combineTextFile(sc, "file:///test/*")
// or val sessions = Loaders.combineTextFile(sc, conf.weblogs(), size = 256, delim = "\n")
// where size is split size in Megabytes, delim - line break character
println(sessions.count())
答案 1 :(得分:3)
我很确定你获得OOM的原因是因为处理了这么多小文件。你想要的是组合输入文件,这样你就不会得到这么多分区。我尝试将我的工作限制在大约10k分区。
在textFile
之后,你可以使用.coalesce(10000, false)
...不是100%肯定会有效,因为我已经有一段时间了,请告诉我。所以试试
sc.textFile(path).coalesce(10000, false)
答案 2 :(得分:1)
您可以使用此
首先,您可以获得一个缓冲区/ S3路径列表/ HDFS或本地路径相同
如果您正在尝试使用Amazon S3,那么:
import scala.collection.JavaConverters._
import java.util.ArrayList
import com.amazonaws.services.s3.AmazonS3Client
import com.amazonaws.services.s3.model.ObjectListing
import com.amazonaws.services.s3.model.S3ObjectSummary
import com.amazonaws.services.s3.model.ListObjectsRequest
def listFiles(s3_bucket:String, base_prefix : String) = {
var files = new ArrayList[String]
//S3 Client and List Object Request
var s3Client = new AmazonS3Client();
var objectListing: ObjectListing = null;
var listObjectsRequest = new ListObjectsRequest();
//Your S3 Bucket
listObjectsRequest.setBucketName(s3_bucket)
//Your Folder path or Prefix
listObjectsRequest.setPrefix(base_prefix)
//Adding s3:// to the paths and adding to a list
do {
objectListing = s3Client.listObjects(listObjectsRequest);
for (objectSummary <- objectListing.getObjectSummaries().asScala) {
files.add("s3://" + s3_bucket + "/" + objectSummary.getKey());
}
listObjectsRequest.setMarker(objectListing.getNextMarker());
} while (objectListing.isTruncated());
//Removing Base Directory Name
files.remove(0)
//Creating a Scala List for same
files.asScala
}
现在将此List对象传递给以下代码段,注意:sc是SQLContext的对象
var df: DataFrame = null;
for (file <- files) {
val fileDf= sc.textFile(file)
if (df!= null) {
df= df.unionAll(fileDf)
} else {
df= fileDf
}
}
现在你有一个最终的统一RDD,即df
可选,您也可以在一个BigRDD
中重新分区val files = sc.textFile(filename, 1).repartition(1)
重新分区始终有效:D