动态希腊字母作为RMarkdown表中的变量名称

时间:2014-07-04 02:02:29

标签: r r-markdown reproducible-research

我如何获得xtable(虽然我也有pander.table的这个问题)将希腊字母分配给打印函数中的数据框的列,而不需要渲染表,然后手动输入Latex作为希腊字母?

以下是可重复示例的数据:

#data in 
chiSq <- 1600
df <- 850
p <- 0.95
CFI <- 0.95
TLI <- 0.95 
RMSEA <- 0.04
LOWRMSEA <- 0.03
HIGHRMSEA <- 0.04

我通常有一些看起来像这样的数据框。

fit.stat <- data.frame(chiSq, df, p, CFI, TLI, RMSEA, LOWRMSEA, HIGHRMSEA)

以下是我在使用xtable创建数据框表时经常遇到的一些具体问题:

  • 我想做的是将chiSq更改为卡方的符号。在latex中,$x^2$将呈现相应的符号。
  • 我还需要p用斜体字表示。
  • 最后,LOWRMSEA和HIGHRMSEA是上限和下限,我希望它们删除列名并将数据包含在RMSEA列中,与置信区间相同。

我发现这样做的唯一方法是首先使用此命令打印表

library(xtable)
print(xtable(fit.stat, caption = "Model Fit Information for CFA"), 
caption.placement="top",
type = "latex")

产生这个:

\begin{table}[ht]
\centering
\caption{Model Fit Information for CFA}
\begin{tabular}{rrrrrrrrr}
  \hline
 & chiSq & df & p & CFI & TLI & RMSEA & LOWRMSEA & HIGHRMSEA \\ 
  \hline
1 & 1600.00 & 850.00 & 0.95 & 0.95 & 0.95 & 0.04 & 0.03 & 0.04 \\ 
   \hline
\end{tabular}
\end{table}

然而,我需要手动编辑表来创建它:

\begin{table}[ht]
\centering
\caption{Model Fit Information for CFA}
\begin{tabular}{rrrrrrrrrrrr}
  \hline
 & $x^2$ & {\it df} & {\it p} & CFI & TLI & RMSEA\\ 
  \hline
&1600.00 & 850.00 & 0.00 & 0.95 & 0.95 & 0.04 (0.03 - 0.04) \\ 
   \hline
\end{tabular}
\end{table}

我希望能够动态地执行此操作而无需手动编辑表格,以便我可以将其作为代码块包含在markdown doc中。 感谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

至于合并RMSEA&amp; LOWRMSEA&amp; HIGHRMSEA值,可能最好在data.frame中作为粘贴。例如

fit.stat <- data.frame(chiSq, df, p, CFI, TLI, 
    RMSEA = paste0(RMSEA , " (",LOWRMSEA," - ", HIGHRMSEA,")"))

然后,对于列名称,您可以通过指定自定义print.xtable函数来覆盖sanitize的清理功能。因为我确定你已经知道了,通常所有的特别的&#34; LaTeX字符被剥离或转义,以免干扰布局。但是,在这里我们可以创建一个替代我们的函数。首先,我们定义一个函数

formatcolheads<-function(x) {
    sanitize<-get("sanitize", parent.frame())
    x<-sanitize(x)
    x<-gsub("chiSq","$x^2$",x)
    x<-gsub("df","{\\\\it df}",x)
    x<-gsub("p","{\\\\it p}",x)
    x
}

请注意,我做了一些工作来获取默认的sanitize函数并在列上运行它以确保没有任何问题。然后我去替换你想要改变的值。请注意,我们必须为&#34;它填充双重转义斜杠。但是我们使用像这样的函数

print(xtable(fit.stat, caption = "Model Fit Information for CFA"), 
caption.placement="top", sanitize.colnames.function = formatcolheads,
type = "latex")

并产生

\begin{table}[ht]
\centering
\caption{Model Fit Information for CFA} 
\begin{tabular}{rrrrrrl}
  \hline
 & $x^2$ & {\it df} & {\it p} & CFI & TLI & RMSEA \\ 
  \hline
1 & 1600.00 & 850.00 & 0.95 & 0.95 & 0.95 & 0.04 (0.03 - 0.04) \\ 
   \hline
\end{tabular}
\end{table}

似乎是您想要的输出。