是否有人熟悉CAGE分析？我正在使用CAGEr包来处理Fantom5数据集。
但是，我无法加载Fantom5数据。我认为原因是要么我找不到合适的包装名称，要么没有像Fantom3和4这样的包装。
对于Fantom3和4，只需使用biocLite
biocLite("FANTOM3and4CAGE")
然后我能够做到
library(FANTOM3and4CAGE)
data(FANTOMhumanSamples)
之前是否有人处理此数据集？
非常感谢
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我通过电子邮件发送了这个软件包的开发人员，顺便说一句，这个软件包非常好。
这是因为FANTOM5humanSamples和获取FANTOM5数据的功能可从CAGEr软件包版本1.6获得，它将由最新版本的R中的Bioconductor版本2.14安装。如果您使用的是较旧的版本R默认情况下使用Bioconductor版本2.12。并安装旧版本的CAGEr（1.2.9。）