如何选择每组中具有最大值的行

时间:2014-07-03 15:54:12

标签: r

目前我遇到如下问题。在存在每个主题的多个观察的数据集中,我想制作该数据集的子集,其中仅选择记录的最大数据。例如,对于如下数据集:

ID <- c(1,1,1,2,2,2,2,3,3)
Value <- c(2,3,5,2,5,8,17,3,5)
Event <- c(1,1,2,1,2,1,2,2,2)

group <- data.frame(Subject=ID, pt=Value, Event=Event)

对象1,2和3的最大pt值分别为5,17和5。我怎么能首先找到每个主题的最大pt值,然后将这个观察结果放在另一个数据框中?这意味着该子集仅具有每个主题的最大pt值。

17 个答案:

答案 0 :(得分:73)

这是一个data.table解决方案:

require(data.table) ## 1.9.2
group <- as.data.table(group)

如果您希望在每个组中保留与pt的最大值相对应的所有条目:

group[group[, .I[pt == max(pt)], by=Subject]$V1]
#    Subject pt Event
# 1:       1  5     2
# 2:       2 17     2
# 3:       3  5     2

如果您只想要pt的第一个最大值:

group[group[, .I[which.max(pt)], by=Subject]$V1]
#    Subject pt Event
# 1:       1  5     2
# 2:       2 17     2
# 3:       3  5     2

在这种情况下,它没有什么区别,因为数据中的任何组中都没有多个最大值。

答案 1 :(得分:32)

最直观的方法是在dplyr中使用group_by和top_n函数

    group %>% group_by(Subject) %>% top_n(1, pt)

你得到的结果是

    Source: local data frame [3 x 3]
    Groups: Subject [3]

      Subject    pt Event
        (dbl) (dbl) (dbl)
    1       1     5     2
    2       2    17     2
    3       3     5     2

答案 2 :(得分:28)

使用data.table的简短解决方案:

setDT(group)[, .SD[which.max(pt)], by=Subject]
#    Subject pt Event
# 1:       1  5     2
# 2:       2 17     2
# 3:       3  5     2

答案 3 :(得分:9)

dplyr解决方案:

library(dplyr)
ID <- c(1,1,1,2,2,2,2,3,3)
Value <- c(2,3,5,2,5,8,17,3,5)
Event <- c(1,1,2,1,2,1,2,2,2)
group <- data.frame(Subject=ID, pt=Value, Event=Event)

group %>%
    group_by(Subject) %>%
    summarize(max.pt = max(pt))

这会产生以下数据框:

  Subject max.pt
1       1      5
2       2     17
3       3      5

答案 4 :(得分:6)

自{dplyr} v1.0.0版(2020年5月)以来,新的slice_*语法取代了top_n()

另请参阅https://dplyr.tidyverse.org/reference/slice.html

library(tidyverse)

ID    <- c(1,1,1,2,2,2,2,3,3)
Value <- c(2,3,5,2,5,8,17,3,5)
Event <- c(1,1,2,1,2,1,2,2,2)

group <- data.frame(Subject=ID, pt=Value, Event=Event)

group %>% 
  group_by(Subject) %>% 
  slice_max(pt)
#> # A tibble: 3 x 3
#> # Groups:   Subject [3]
#>   Subject    pt Event
#>     <dbl> <dbl> <dbl>
#> 1       1     5     2
#> 2       2    17     2
#> 3       3     5     2

reprex package(v0.3.0.9001)于2020-08-18创建

会话信息
sessioninfo::session_info()
#> ─ Session info ───────────────────────────────────────────────────────────────
#>  setting  value                                      
#>  version  R version 4.0.2 Patched (2020-06-30 r78761)
#>  os       macOS Catalina 10.15.6                     
#>  system   x86_64, darwin17.0                         
#>  ui       X11                                        
#>  language (EN)                                       
#>  collate  en_US.UTF-8                                
#>  ctype    en_US.UTF-8                                
#>  tz       Europe/Berlin                              
#>  date     2020-08-18                                 
#> 
#> ─ Packages ───────────────────────────────────────────────────────────────────
#>  package     * version    date       lib source                            
#>  assertthat    0.2.1      2019-03-21 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  backports     1.1.8      2020-06-17 [1] CRAN (R 4.0.1)                    
#>  blob          1.2.1      2020-01-20 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  broom         0.7.0      2020-07-09 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  cellranger    1.1.0      2016-07-27 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  cli           2.0.2      2020-02-28 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  colorspace    1.4-1      2019-03-18 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  crayon        1.3.4      2017-09-16 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  DBI           1.1.0      2019-12-15 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  dbplyr        1.4.4      2020-05-27 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  digest        0.6.25     2020-02-23 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  dplyr       * 1.0.1      2020-07-31 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  ellipsis      0.3.1      2020-05-15 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  evaluate      0.14       2019-05-28 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  fansi         0.4.1      2020-01-08 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  forcats     * 0.5.0      2020-03-01 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  fs            1.5.0      2020-07-31 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  generics      0.0.2      2018-11-29 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  ggplot2     * 3.3.2      2020-06-19 [1] CRAN (R 4.0.1)                    
#>  glue          1.4.1      2020-05-13 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  gtable        0.3.0      2019-03-25 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  haven         2.3.1      2020-06-01 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  highr         0.8        2019-03-20 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  hms           0.5.3      2020-01-08 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  htmltools     0.5.0      2020-06-16 [1] CRAN (R 4.0.1)                    
#>  httr          1.4.2      2020-07-20 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  jsonlite      1.7.0      2020-06-25 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  knitr         1.29       2020-06-23 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  lifecycle     0.2.0      2020-03-06 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  lubridate     1.7.9      2020-06-08 [1] CRAN (R 4.0.1)                    
#>  magrittr      1.5        2014-11-22 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  modelr        0.1.8      2020-05-19 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  munsell       0.5.0      2018-06-12 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  pillar        1.4.6      2020-07-10 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  pkgconfig     2.0.3      2019-09-22 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  purrr       * 0.3.4      2020-04-17 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  R6            2.4.1      2019-11-12 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  Rcpp          1.0.5      2020-07-06 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  readr       * 1.3.1      2018-12-21 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  readxl        1.3.1      2019-03-13 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  reprex        0.3.0.9001 2020-08-13 [1] Github (tidyverse/reprex@23a3462) 
#>  rlang         0.4.7      2020-07-09 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  rmarkdown     2.3.3      2020-07-26 [1] Github (rstudio/rmarkdown@204aa41)
#>  rstudioapi    0.11       2020-02-07 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  rvest         0.3.6      2020-07-25 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  scales        1.1.1      2020-05-11 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  sessioninfo   1.1.1      2018-11-05 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  stringi       1.4.6      2020-02-17 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  stringr     * 1.4.0      2019-02-10 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  styler        1.3.2.9000 2020-07-05 [1] Github (pat-s/styler@51d5200)     
#>  tibble      * 3.0.3      2020-07-10 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  tidyr       * 1.1.1      2020-07-31 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  tidyselect    1.1.0      2020-05-11 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  tidyverse   * 1.3.0      2019-11-21 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  utf8          1.1.4      2018-05-24 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  vctrs         0.3.2      2020-07-15 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  withr         2.2.0      2020-04-20 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  xfun          0.16       2020-07-24 [1] CRAN (R 4.0.2)                    
#>  xml2          1.3.2      2020-04-23 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#>  yaml          2.2.1      2020-02-01 [1] CRAN (R 4.0.0)                    
#> 
#> [1] /Users/pjs/Library/R/4.0/library
#> [2] /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library

答案 5 :(得分:6)

我不确定你想要对事件专栏做什么,但如果你想保留它,那么

isIDmax <- with(dd, ave(Value, ID, FUN=function(x) seq_along(x)==which.max(x)))==1
group[isIDmax, ]

#   ID Value Event
# 3  1     5     2
# 7  2    17     2
# 9  3     5     2

在这里,我们使用ave来查看&#34; Value&#34;每个&#34; ID&#34;的列。然后我们确定哪个值是最大值然后将其转换为逻辑向量,我们可以使用它来对原始data.frame进行子集化。

答案 6 :(得分:2)

do.call(rbind, lapply(split(group,as.factor(group$Subject)), function(x) {return(x[which.max(x$pt),])}))

使用基础R

答案 7 :(得分:2)

另一个基本解决方案

group_sorted <- group[order(group$Subject, -group$pt),]
group_sorted[!duplicated(group_sorted$Subject),]

# Subject pt Event
#       1  5     2
#       2 17     2
#       3  5     2

通过pt(降序)对数据框进行排序,并删除在Subject中重复的删除行

答案 8 :(得分:1)

这是另一种data.table解决方案,因为which.max不适用于字符

library(data.table)
group <- data.table(Subject=ID, pt=Value, Event=Event)

group[, .SD[order(pt, decreasing = TRUE) == 1], by = Subject]

答案 9 :(得分:1)

base 中,您可以使用ave获取每个组的max并将其与pt进行比较,并获得一个逻辑向量来对{{1} }。

data.frame

或者已经在函数中进行了比较。

group[group$pt == ave(group$pt, group$Subject, FUN=max),]
#  Subject pt Event
#3       1  5     2
#7       2 17     2
#9       3  5     2

答案 10 :(得分:1)

bytapply的数据帧版本:

res <- by(group, group$Subject, FUN=function(df) df[which.max(df$pt),])

它返回类by的对象,因此我们将其转换为数据帧:

do.call(rbind, b)
  Subject pt Event
1       1  5     2
2       2 17     2
3       3  5     2

答案 11 :(得分:1)

另一个选项是slice

library(dplyr)
group %>%
     group_by(Subject) %>%
     slice(which.max(pt))
#    Subject    pt Event
#    <dbl> <dbl> <dbl>
#1       1     5     2
#2       2    17     2
#3       3     5     2

答案 12 :(得分:0)

另一个bins选项:

geom_histogram()

或其他(可读性较差,但速度稍快):

data.table

计时代码:

library(data.table)
setDT(group)
group[group[order(-pt), .I[1L], Subject]$V1]

时间:

group[group[, rn := .I][order(Subject, -pt), {
    rn[c(1L, 1L + which(diff(Subject)>0L))]
}]]

答案 13 :(得分:0)

另一种data.table解决方案:

library(data.table)
setDT(group)[, head(.SD[order(-pt)], 1), by = .(Subject)]

答案 14 :(得分:0)

另一种基础R解决方案:

merge(aggregate(pt ~ Subject, max, data = group), group)

  Subject pt Event
1       1  5     2
2       2 17     2
3       3  5     2

答案 15 :(得分:0)

如果您希望某个主题的最大pt值,可以使用:

   pt_max = as.data.frame(aggregate(pt~Subject, group, max))

答案 16 :(得分:0)

使用dplyr 1.0.2,现在有两种方法可以做到这一点,一种是长手,另一种是使用动词cross():

var target = Math.ceil(Math.random() * 10); 
var guess= false; 
var tries=5; 
console.log(target);

while (tries>0) { 
    guess = Math.ceil(Math.random() * 10); 
    tries = tries - 1; 
    console.log(guess); 
    if(guess === target){ 
        console.log(guess); break; 
    } 
}

长动词为max(),但请注意na.rm = TRUE,它对于示例中存在NA的示例很有用:Merge rows in a dataframe where the rows are disjoint and contain NAs

      # create data
      ID    <- c(1,1,1,2,2,2,2,3,3)
      Value <- c(2,3,5,2,5,8,17,3,5)
      Event <- c(1,1,2,1,2,1,2,2,2)
      
      group <- data.frame(Subject=ID, pt=Value, Event=Event)

如果只有几列,但该表有很多列,则可以。此动词的示例通常带有summarise(across(start_with ...,但在此示例中,列并非以相同的字符开头。可以更改它们或列出位置:

       group %>% 
        group_by(Subject) %>% 
        summarise(pt = max(pt, na.rm = TRUE),
                  Event = max(Event, na.rm = TRUE))

动词cross()1的注释指的是第一列之后的第一列,因此使用ncol(group)将不起作用,因为列太多了(将其置于第4位比3)。