getblast错误不可用matlab

Question

我编写的matlab代码应该迭代列表序列并一次爆炸。以下是代码的相关部分：

%blast the seq

[res, ROTE] = blastncbi(seq, 'blastn');
res1 = getblast(res, 'WaitTime',ROTE);
resName = res1.Hits(1).Name

对于某些seq＆＃39;它有效，然后在最后它给了我这个错误消息：

Error using getblast (line 176)
BLAST V7EBUE0901R is unavailable - try later.

请注意，我已将ROTE定义为“等待时间”＆＃39;值，如该函数的文档中所建议的那样。

脚本必须遍历大量的基因，所以我不能让它每5分钟崩溃一次！

Answer 1

RTOE返回的blastncbi是估算的时间。也许估计有时是不正确的。

处理此问题的两种简单方法可能是等待更长时间，或者尝试两次：

res1 = getblast(res, 'WaitTime',ROTE*10);

或

try
   res1 = getblast(res, 'WaitTime',ROTE);
catch
   res1 = getblast(res, 'WaitTime',ROTE);
end

当然，这假设您确定您请求的信息实际可用。