以下是摘要：
我在Eclipse上有一个包含大量类和Maven依赖项的大型项目。这个java类是我打算制作的脚本的一部分。基本上，这个类集合将由脚本使用java和javac或whatnot调用，反过来，程序将输出许多JSON文件以供HTML文件解释。
最好的方法是什么？我尝试使用JARS并独立运行它们，但由于某种原因，Maven依赖项没有包含在内，所以有些类（如JSONObject）不起作用。
你可能会说，我是一个相对初学的开发者，所以我很感激任何帮助。提前谢谢。
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Maven为您提供了构建具有依赖项的可执行jar的工具。您只需要相应地配置POM文件。
Maven: Packaging dependencies alongside project JAR?
以上网址可以解释配置POM的详细信息。
修改
如果您想要自己的没有MAVEN的JAR配置，那么您需要了解Manifest文件。
JAR文件支持广泛的功能，包括电子签名，版本控制，封装密封等。什么赋予JAR文件这种多功能性？答案是JAR文件的清单。
清单是一个特殊文件，可以包含有关JAR文件中打包的文件的信息。通过定制清单包含的此“元”信息，您可以启用JAR文件以用于各种目的。
详细信息可在以下位置找到：
http://docs.oracle.com/javase/tutorial/deployment/jar/manifestindex.html