lme中系数的协方差(或相关)矩阵

时间:2014-06-29 16:09:57

标签: r

我使用nlme包的lme函数拟合了线性混合模型。 '总结'命令显示系数,它们的标准误差和系数的相关矩阵。 如何在R数据集形式中获得此相关矩阵(协方差矩阵也很好)?

lm命令(对于线性模型)确实在对象'摘要(lm5)$ cov.nnscaled'中提供协方差矩阵。我想在lme函数中找到这个对应物。

1 个答案:

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如果需要固定效果的方差 - 协方差矩阵,请使用

vcov(fitted.model)

如果您需要相关矩阵,请使用

cov2cor(vcov(fitted.model))

您也可以使用

summary(fitted.model)$corFixed

(使用str(summary(fitted.model))查找您需要的位数),但上面的访问器更好,因为它们不会使用结果的(不一定是稳定的)内部结构。