我正在尝试制作一个堆积条形图,其中X轴为时间,Y轴为数量,填充颜色为某些特征。
我的数据看起来像这样:
> base
Number Mut Time Percent
1 117 22:A->G 2 81.81
2 13 24:G->A 2 9.09
3 10 22:A->G 24:G->A 108:G->A 158:G->A 162:G->A 2 6.99
4 1 22:A->G 24:G->A 2 0.69
5 32 24:G->A 3 94.11
6 1 24:G->A 162:G->T 3 2.94
7 1 24:G->A 82:G->T 3 2.94
当我使用代码在ggplot中执行堆积条形图时:
ggplot(base,aes(x = Time, fill = Mut, y = Percent)) + geom_bar(stat='identity') + theme(legend.key.size = unit(.5, "cm")) + ylab("Number")
我得到一个如下图:
http://imgur.com/32XCkTm,yfCAJsx#0
我的问题是我希望time = 1和time = 4的值为零。
类似的东西:
http://imgur.com/32XCkTm,yfCAJsx#1
有没有办法可以做到这一点?现在我只是在数据中为时间1和4添加0值,并将我的填充特征(Mut)添加到已经显示在数据中的那个:
> base
Reads Mut Time Percent
1 0 22:A->G 1 0.00
2 117 22:A->G 2 81.81
3 13 24:G->A 2 9.09
4 10 22:A->G 24:G->A 108:G->A 158:G->A 162:G->A 2 6.99
5 1 22:A->G 24:G->A 2 0.69
6 32 24:G->A 3 94.11
7 1 24:G->A 162:G->T 3 2.94
8 1 24:G->A 82:G->T 3 2.94
9 0 22:A->G 4 0.00
我的问题是我不想继续搜索数据中已有的功能(Mut)。有没有办法让ggplot自动为时间= 1和时间= 4设置x值,没有条形图而不必为数据添加值?我一直在寻找几个小时,无法找到任何答案。
感谢。
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添加+ scale_x_discrete(limits = 1:4)