基于起始节点和终端节点的子图提取

Question

我必须问这个问题，因为我不确定这个问题是否困难或容易。我想在igraph中提取一个子图但有以下绑定：从Viridiplantae-3开始到Proteobacteria-2（见图片）

我可以从shortest.path（）找到路径，但我不知道如何根据节点列表提取子图。因为shortest.path不包含Proteobacteria-1和Proteobacteria-2。我不想包含100.2：Viridiplantae-1，Viridiplantae-2和68.1：Stramenopiles-1，Rhodophyta-1。

简而言之，给定Viridiplantae-3和Proteobacteria-2，我想提取红色的所有内容。

可重复的说明：

library(ape)

library(igraph)

cat("(((Viridiplantae_1:1.22123006e-06,Viridiplantae_2:1.22123006e-06)100.2:0.9709833387,Viridiplantae_3:1.217705775)100.1:1.394125713,((Proteobacteria_1:0.2479324862,Proteobacteria_2:0.4385740351)100.3:0.696357212,(Rhodophyta_1:1.675875775,Stramenopiles_1:1.869948709)68.1:0.48853466)52.1:0.2231628399,Proteobacteria_3:0.8491431473);", file = "testTree.tre", sep = "\n")

cur_Tree <- read.tree("testTree.tre")

cur_Tree$node.label[1] <- "root" 

cur_Grph <- as.igraph(cur_Tree)

cur_Grph是图像中的图形