计算R中向量内的所有成对差异

时间:2014-06-19 19:33:27

标签: r

有几个关于计算向量之间成对差异的帖子,但我找不到如何计算向量中的所有差异。

说我有一个矢量,v。

v<-c(1:4)

我想生成第二个向量,它是向量中所有成对差异的绝对值。类似于:

abs(1-2) = 1
abs(1-3) = 2
abs(1-4) = 3
abs(2-3) = 1
abs(2-4) = 2
abs(3-4) = 1

输出将是6个值的向量,这是我的6次比较的结果:

output<- c(1,2,3,1,2,1)

R中是否有可以执行此操作的功能?

3 个答案:

答案 0 :(得分:17)

as.numeric(dist(v))

似乎有效;它将v视为列矩阵并计算行之间的欧几里德距离,在本例中为sqrt((x-y)^2)=abs(x-y)

如果我们正在打高尔夫球,那么我会提供c(dist(v)),这是相同的,而我猜测它将是无与伦比的。

@AndreyShabalin指出,使用method="manhattan"可能会稍微提高效率,因为它避免了平方/正方形的东西。

答案 1 :(得分:14)

让我们打高尔夫球

abs(apply(combn(1:4,2), 2, diff))

@Ben,你的杀手锏!

> system.time(apply(combn(1:1000,2), 2, diff))
   user  system elapsed 
   6.65    0.00    6.67 
> system.time(c(dist(1:1000)))
   user  system elapsed 
   0.02    0.00    0.01 
> system.time({
+ v <- 1:1000
+ z = outer(v,v,'-');
+ z[lower.tri(z)];
+ })
   user  system elapsed 
   0.03    0.00    0.03 

谁知道优雅(易懂易懂/灵活)的代码可能会很慢。

答案 2 :(得分:12)

可能的解决方案是:

z = outer(v,v,'-'); 
z[lower.tri(z)];

[1] 1 2 3 1 2 1