(1)我有以下data.frame:
queryHits subjectHits
<integer> <integer>
1 1 246
2 1 247
3 1 248
4 1 249
5 1 250
我有两个数据框:
(2)数据集与注释数据:
celltype
<character>
1 Non-Gene Associated|Reg.Feats K562
2 Unclassified|Reg.Feats NHEK
3 Gene Associated|Reg.Feats GM06990
4 Unclassified|Reg.Feats MultiCell
5 Unclassified|Reg.Feats HSMM
(3)数据集2需要注释
annotation
<character>
1 Unclassified|Reg.Feats HUVEC
2 Unclassified|Reg.Feats HUVEC
3 Unclassified|Reg.Feats HUVEC
4 Unclassified|Reg.Feats HUVEC
5 Unclassified|Reg.Feats HUVEC
(1)告诉我在(3)中需要添加(2)中的注释。 (例如,(1)的子集告诉我们,来自(2)中的行246,247,248,249,250的注释都需要被添加到(3)的第1行)。我的问题是(3)需要在同一个字段中有多个注释。现在我只能做出一个解决方案,每次添加一个新的注释时,(3)中的注释都会被覆盖。
mcols(vcfData)$annotation[queryHits(hits)] <- mcols(encodeData)$celltype[subjectHits(hits)]
您是否有一个智能解决方案可以将多个注释添加到同一个字段?
由于
答案 0 :(得分:0)
如果没有完整的示例,很难重现,但您可以尝试将注释添加为列表变量。
例如,
n = c(2, 3, 5)
s = c("aa", "bb", "cc", "dd", "ee")
s <- data.frame(s)
s$n <- list(n)
> s
s n
1 aa 2, 3, 5
2 bb 2, 3, 5
3 cc 2, 3, 5
4 dd 2, 3, 5
5 ee 2, 3, 5