在Cygwin中永久设置Anaconda的Python路径

时间:2014-06-17 03:47:12

标签: python windows cygwin anaconda

我正在尝试在我的Windows 7机器上安装Anaconda。我经常使用cygwin来完成我的命令行工作,我想从那里管理Anaconda。我已经通过图形安装程序没有任何问题,并检查了必要的框以重置我的python安装的默认路径。我继续检查python的位置,最初我得到了这个......

$ which python
/usr/bin/python

从这里python工作得很好......

$ python
Python 2.7.5 (default, Oct  2 2013, 22:34:09)
[GCC 4.8.1] on cygwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.

但我正在尝试从anaconda工作,所以我应该重新定义我的路径......

$ export PATH=/cygdrive/c/anaconda:$PATH
$ which python
/cygdrive/c/anaconda/python

现在我应该好好去,但是当我尝试进入python时,它只是挂起

$ python

知道为什么会这样吗?详细回报,下面......

$ python -v
# installing zipimport hook
import zipimport # builtin
# installed zipimport hook
# C:\anaconda\lib\site.pyc matches C:\anaconda\lib\site.py
import site # precompiled from C:\anaconda\lib\site.pyc
# C:\anaconda\lib\os.pyc matches C:\anaconda\lib\os.py
import os # precompiled from C:\anaconda\lib\os.pyc
import errno # builtin
import nt # builtin
# C:\anaconda\lib\ntpath.pyc matches C:\anaconda\lib\ntpath.py
import ntpath # precompiled from C:\anaconda\lib\ntpath.pyc
# C:\anaconda\lib\stat.pyc matches C:\anaconda\lib\stat.py
import stat # precompiled from C:\anaconda\lib\stat.pyc
# C:\anaconda\lib\genericpath.pyc matches C:\anaconda\lib\genericpath.py
import genericpath # precompiled from C:\anaconda\lib\genericpath.pyc
# C:\anaconda\lib\warnings.pyc matches C:\anaconda\lib\warnings.py
import warnings # precompiled from C:\anaconda\lib\warnings.pyc
# C:\anaconda\lib\linecache.pyc matches C:\anaconda\lib\linecache.py
import linecache # precompiled from C:\anaconda\lib\linecache.pyc
# C:\anaconda\lib\types.pyc matches C:\anaconda\lib\types.py
import types # precompiled from C:\anaconda\lib\types.pyc
# C:\anaconda\lib\UserDict.pyc matches C:\anaconda\lib\UserDict.py
import UserDict # precompiled from C:\anaconda\lib\UserDict.pyc
# C:\anaconda\lib\_abcoll.pyc matches C:\anaconda\lib\_abcoll.py
import _abcoll # precompiled from C:\anaconda\lib\_abcoll.pyc
# C:\anaconda\lib\abc.pyc matches C:\anaconda\lib\abc.py
import abc # precompiled from C:\anaconda\lib\abc.pyc
# C:\anaconda\lib\_weakrefset.pyc matches C:\anaconda\lib\_weakrefset.py
import _weakrefset # precompiled from C:\anaconda\lib\_weakrefset.pyc
import _weakref # builtin
# C:\anaconda\lib\copy_reg.pyc matches C:\anaconda\lib\copy_reg.py
import copy_reg # precompiled from C:\anaconda\lib\copy_reg.pyc
# C:\anaconda\lib\traceback.pyc matches C:\anaconda\lib\traceback.py
import traceback # precompiled from C:\anaconda\lib\traceback.pyc
# C:\anaconda\lib\sysconfig.pyc matches C:\anaconda\lib\sysconfig.py
import sysconfig # precompiled from C:\anaconda\lib\sysconfig.pyc
# C:\anaconda\lib\re.pyc matches C:\anaconda\lib\re.py
import re # precompiled from C:\anaconda\lib\re.pyc
# C:\anaconda\lib\sre_compile.pyc matches C:\anaconda\lib\sre_compile.py
import sre_compile # precompiled from C:\anaconda\lib\sre_compile.pyc
import _sre # builtin
# C:\anaconda\lib\sre_parse.pyc matches C:\anaconda\lib\sre_parse.py
import sre_parse # precompiled from C:\anaconda\lib\sre_parse.pyc
# C:\anaconda\lib\sre_constants.pyc matches C:\anaconda\lib\sre_constants.py
import sre_constants # precompiled from C:\anaconda\lib\sre_constants.pyc
# C:\anaconda\lib\locale.pyc matches C:\anaconda\lib\locale.py
import locale # precompiled from C:\anaconda\lib\locale.pyc
import encodings # directory C:\anaconda\lib\encodings
# C:\anaconda\lib\encodings\__init__.pyc matches C:\anaconda\lib\encodings\__init__.py
import encodings # precompiled from C:\anaconda\lib\encodings\__init__.pyc
# C:\anaconda\lib\codecs.pyc matches C:\anaconda\lib\codecs.py
import codecs # precompiled from C:\anaconda\lib\codecs.pyc
import _codecs # builtin
# C:\anaconda\lib\encodings\aliases.pyc matches C:\anaconda\lib\encodings\aliases.py
import encodings.aliases # precompiled from C:\anaconda\lib\encodings\aliases.pyc
import operator # builtin
# C:\anaconda\lib\functools.pyc matches C:\anaconda\lib\functools.py
import functools # precompiled from C:\anaconda\lib\functools.pyc
import _functools # builtin
import _locale # builtin
# C:\anaconda\lib\encodings\cp1252.pyc matches C:\anaconda\lib\encodings\cp1252.py
import encodings.cp1252 # precompiled from C:\anaconda\lib\encodings\cp1252.pyc
# zipimport: found 13 names in C:\anaconda\lib\site-packages\runipy-0.1.0-py2.7.egg
# zipimport: found 144 names in C:\anaconda\lib\site-packages\setuptools-3.6-py2.7.egg
Python 2.7.7 |Anaconda 2.0.1 (64-bit)| (default, Jun 11 2014, 10:40:02) [MSC v.1500 64 bit (AMD64)] on win32
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
Anaconda is brought to you by Continuum Analytics.
Please check out: http://continuum.io/thanks and htt

我遇到的另一个(可能是相关的)问题是每次关闭/打开cygwin时都需要重置路径。我已将以下文本输入.bashrc和.profile以尝试永久设置路径:

# Set path to python from anaconda install
export PATH=/cygdrive/c/anaconda:$PATH

打开和关闭cygwin后,我回到:

$ which python
/usr/bin/python

这可能与设置某些系统环境变量有关吗?

8 个答案:

答案 0 :(得分:28)

要在Cygwin中使用交互式Python shell,我使用-i选项。

为了从Anaconda安装中获取它,我使用了上面建议的步骤:

$ export PATH=/cygdrive/c/anaconda:$PATH
$ which python
/cygdrive/c/anaconda/python

然后我使用-i选项在Cygwin中启动python:

$ python -i
Python 2.7.8 |Anaconda 2.1.0 (64-bit)| (default, Jul  2 2014, 15:12:11) [MSC v.1500 64 bit (AMD64)] on win32
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
Anaconda is brought to you by Continuum Analytics.
Please check out: http://continuum.io/thanks and https://binstar.org
>>>>

图书馆工作正常。例如,现在可以导入pandas库(通过Anaconda安装)。

>>>> import pandas
>>>> pandas.DataFrame
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>

现在为了使这个永久化,我在我的bashrc文件中添加了路径:

$ echo 'export PATH=/cygdrive/c/anaconda:$PATH' >> .bashrc
$ source .bashrc
$ which python
/cygdrive/c/anaconda/python

我希望这会有所帮助。

答案 1 :(得分:3)

路径

关于您的路径问题,请参阅Installing anaconda to use with windows了解如何解决此问题。或者,你可以运行/cygdrive/c/Anaconda/python.exe来启动Anaconda / windows python并让标准python指向cygwin版本。

请注意,互联网上提供的一些建议也包括对PYTHONPATH的必要更改:如果您使用anaconda / windows python,您还需要anaconda python库。像numpy这样的二进制模块如果你混淆了肯定会崩溃或行为不端。检查这个的最简单方法是在cygwin中安装一个模块,在Conda中不需要它并测试是否可以从anaconda python导入它。如果可以,你的道路是错的。

Anaconda python会自动将c:\Anconda添加到你的PYTHONPATH中,但是如果你将它设置为服务CYGWIN python库,那么它们将在Anaconda libs之前找到。尝试

import sys
sys.path

终端

然而,这也是一个终端问题:Anaconda(Windows)python期望一个Windows shell和一个现代的cygwin shell就像一个xterm,所以非常不同。通过运行python --help进行诊断,如果有效但python挂起,则交互式提示是问题所在。这意味着你可以运行python程序,你就是无法与它们进行交互。

解决这个问题的方法是使用cygwin bash shell而不是cygwin terminal(两者都在“开始”菜单中的Cygwin组下)。它们看起来非常相似,但bash shell中的字体不太漂亮,你不能使窗口宽于80个字符(就像所有其他CMD窗口一样,从不理解&#39;功能&#39;)。这是在CMD窗口内运行的cygwin bash,你的anaconda python将是交互式的。 cygwin terminal为你提供了一个以putty派生的形式运行的bash shell,它模仿xterm并且不能被anaconda python使用。

答案 2 :(得分:3)

我也遇到了使用我的Cygwin / Windows 7系统设置anaconda的问题。有用的是:

  1. 编辑〜/ .bashrc。将以下内容添加到文件底部。

    export PATH=/cygdrive/c/Anaconda:$PATH

  2. 通过在Cygwin的控制台中输入which python,将Cygwin的python映射到anaconda发行版。但是,当启动python时,它会挂断,迫使我从命令中删除^ C.我发现python -i将启动交互式python解释器而没有任何问题。

答案 3 :(得分:3)

conda对cygwin的解释还有另外一个问题。当您为环境获取激活脚本时,它会例如。

  

/C/Users/Thomas.Harris/AppData/Local/Continuum/Anaconda3/envs/blah
  /C/Users/Thomas.Harris/AppData/Local/Continuum/Anaconda3/envs/blah/Library/mingw-w64/bin   /C/Users/Thomas.Harris/AppData/Local/Continuum/Anaconda3/envs/blah/Library/usr/bin
  /C/Users/Thomas.Harris/AppData/Local/Continuum/Anaconda3/envs/blah/Library/bin
  /C/Users/Thomas.Harris/AppData/Local/Continuum/Anaconda3/envs/blah/Scripts

到您的PATH。但是,这些不是cygwin中的正确目录。

我用

解决了这个问题

ln -s /cygdrive/c /C

然后如果您创建具有特定版本的python的conda环境,它们应该可以工作。

答案 4 :(得分:1)

关于永久设置路径,edit the .profile in your home directory(这是一个隐藏文件)。

  

.profile(其他名称也有效,请参阅bash手册页)包含bash命令。当bash作为登录shell启动时执行。

在此文件的底部,输入您的设置路径命令:

export PATH=/cygdrive/c/anaconda:$PATH

至于为什么python挂起,请提供更多信息 - 例如python -v的输出是什么?

答案 5 :(得分:1)

我来这里有点晚了,但我和@thomasshouler有同样的问题。尝试将下面的导出行添加到.bash_profile和.profile文件的末尾以及.bashrc文件(如上所述)。确保&#34;来源.bash_profile&#34;等每个文件。

export PATH=/cygdrive/c/anaconda:$PATH

答案 6 :(得分:1)

发现对于Anaconda 4,请执行:

vim /home/[Username]/.bash_profile

追加到最后一行:

PATH=$PATH:/cygdrive/c/Users/[Username]/Anaconda3/Scripts/

这个解决方案对我有用,因为找不到通常的anaconda3 / bin。

答案 7 :(得分:1)

一旦如上所述更新了Cygwin路径,您还可以在.bashrc文件中添加一个别名:

alias python='python -i'

这将从Cygwin bash提示符下以交互模式显示Anaconda python解释器