Question

更新：

在对这个问题的评论中详细介绍了各种各样的事情之后，我的问题已经发生了变化。之前在这个问题中描述的问题可能确实是由于@ apple16所建议的错误的JSON，或者与我的"$PATH"配置有关，正如@RandyLai所讨论的那样。

我可能已经确定了潜在的问题：字符编码。在我的.Rmd文档的YAML前端中使用我的构建变体Sublime Text和变音符号（我在这里询问原始问题时一直在做）导致错误与最初描述的错误不同，我不再似乎得到：

Error en yaml::yaml.load(front_matter)

有趣的是，在RStudio或终端（或从shell脚本）中使用相同的YAML时，不会抛出此错误。当我从YAML中删除变音符号时，我在ST中没有错误;但是，如果我将变音符号放在主文档中，则会在生成的HTML中将其呈现为NA。这种类似于我之前发生的事情，我在下面描述为＆＃34; wackily错误＆＃34; HTML输出。

在对这个问题的评论中，我试图对我的"$PATH"做各种事情，现在，正如@RandyLai所做的那样，似乎没有必要;我指的是将pandoc的路径添加到/etc/launchd.config：在恢复默认路径/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin之后，一切都在ST中工作，因为我现在正在描述它，是否使用我的构建变体在SublimeKnitr-knitr .sublime-build或R Box-R Markdown＆＃39; s .sublime-build中。

以下是我的语言环境信息，如果有用的话：

Mi-Mac:~ LeGastronome$ locale
LANG=
LC_COLLATE="C"
LC_CTYPE="UTF-8"
LC_MESSAGES="C"
LC_MONETARY="C"
LC_NUMERIC="C"
LC_TIME="C"
LC_ALL=

我试图找出Sublime Text如何执行其.sublime-build文件。

在Mac上的Sublime Text 3（v10.9.3）中，我为SublimeKnitr knitr-Markdown和R Box＆＃39; s创建了一个自定义构建版本R Markdown语法;这是前者的.sublime-build文件，它具有完整功能的原始/默认版本，后跟我的错误版本：

{
  "selector": "text.html.markdown.knitr",
  "working_dir": "${project_path:${folder}}",
  "cmd": [ "Rscript -e \"library(knitr); knit('$file', output='$file_path/$file_base_name.md')\"" ],
  "shell": true,

  "variants":
  [
    {
      "name": "Render",
      "working_dir": "$file_path",
      "shell_cmd": "Rscript -e \"rmarkdown::render(input = '$file')\""
    }
  ]
}

这是我的.sublime-build对于R Box的R Markdown，这与SublimeKnitr的knitr-Markdown构建非常相似：

{
    "selector": "text.html.rmarkdown",
    "working_dir": "${project_path:${folder}}",
    "cmd": [ "Rscript -e \"library(knitr); knit('$file', output='$file_path/$file_base_name.md')\"" ],
    "shell": true,

  "variants":
  [
    {
      "name": "Render",
      "working_dir": "$file_path",
      "shell_cmd": "Rscript -e \"rmarkdown::render(input = '$file')\""
    }
  ]
}

在我的自定义构建变体中，我尝试使用上面代码中引用的一对密钥cmd和shell以及shell_cmd，我相信这是新的ST3。在任何情况下，两者都会在我运行时发生不良事件，在终端：

Rscript -e "rmarkdown::render(input = 'path/to/file.Rmd')"

当我在RStudio中跑步时：

rmarkdown::render(input = 'path/to/file.Rmd')

我使用SublimeKnitr的构建得到了与使用R Box的构建时相同的结果。我得到的输出如下：

使用映射：

"cmd": [ "Rscript -e \"rmarkdown::render(input = '$file')\"" ],
"shell": true

我明白了：

Error: pandoc version 1.12.3 or higher is required and was not found.
Ejecuci'on interrumpida
[Finished in 0.4s with exit code 1]
[cmd: ['Rscript -e "rmarkdown::render(input = \'/path/to/file.Rmd\')"']]
[dir: /path/to/pertinent/directory]
[path: /usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin]

请注意，我确实安装了pandoc并且完全可以运行，例如：

Mi-Mac:~ LeGastronome$ pandoc --version
pandoc 1.12.4.2
Compiled with texmath 0.6.6.1, highlighting-kate 0.5.8.1.
Syntax highlighting is supported for the following languages:
    actionscript, ada, apache, asn1, asp, awk, bash, bibtex, boo, c, changelog,
    clojure, cmake, coffee, coldfusion, commonlisp, cpp, cs, css, curry, d,
    diff, djangotemplate, doxygen, doxygenlua, dtd, eiffel, email, erlang,
    fortran, fsharp, gcc, gnuassembler, go, haskell, haxe, html, ini, isocpp,
    java, javadoc, javascript, json, jsp, julia, latex, lex, literatecurry,
    literatehaskell, lua, makefile, mandoc, markdown, matlab, maxima, metafont,
    mips, modelines, modula2, modula3, monobasic, nasm, noweb, objectivec,
    objectivecpp, ocaml, octave, pascal, perl, php, pike, postscript, prolog,
    python, r, relaxngcompact, restructuredtext, rhtml, roff, ruby, rust, scala,
    scheme, sci, sed, sgml, sql, sqlmysql, sqlpostgresql, tcl, texinfo, verilog,
    vhdl, xml, xorg, xslt, xul, yacc, yaml
Default user data directory: /Users/LeGastronome/.pandoc
Copyright (C) 2006-2014 John MacFarlane
Web:  http://johnmacfarlane.net/pandoc
This is free software; see the source for copying conditions.  There is no
warranty, not even for merchantability or fitness for a particular purpose.

带有映射：
```
"shell_cmd": "Rscript -e \"rmarkdown::render(input = '$file')\""
```
我得到了所需类型的文档HTML，但是HTML很糟糕，与我从Terminal和RStudio运行前面提到的代码时所得到的不同;另外，仅在Sublime Text中我收到以下警告：
```
pandoc: YAML header is not an object "source" (line 1, column 1)
```
请注意，如果像上面引用的原始版本配置一样，我使用括号＆＃34; [＆＃34;像这样：
```
"shell_cmd": [ "Rscript -e \"rmarkdown::render(input = '$file')\"" ]
```
当我尝试运行构建变体时，Sublime不会构建也不会执行任何操作。

我的问题似乎是特定于用户的，因此我正在寻找有关如何执行.sublime-build文件的更准确信息。我从some unofficial documentation了解到默认情况下会运行一些Python;但是，如上所述，当我从终端运行相同的代码时，如何包含在我的构建变体中，即：

Rscript -e "rmarkdown::render(input = 'path/to/file.Rmd')"

我从Sublime Text获得了不同的结果？谢谢你的帮助。

Answer 1

您的系统似乎不是英文版。在终端中运行R时，由于“LC_CTYPE”为utf-8，因此R将读取文档为UTF-8文档。但是，如果在Sublime内启动命令，则“LC_CTYPE”为空，因此R不知道要使用的编码。

有几种解决方案。

最简单但不太吸引人的解决方案是将系统语言切换为英语。
另一种可能的方法是通过将LANG = en_US.UTF-8添加到〜/ .Renviron
另一种可能的解决方案是在.sublime-build文件中添加变量LANG。检查选项env here
或者在rmarkdown :: render function中指定UTF8编码。

`.sublime-build如何工作？

1 个答案: