我似乎得到一个奇怪的列表索引超出范围错误:
Traceback (most recent call last):
File "./test.py", line 7, in <module>
print column[2]
IndexError: list index out of range
对于这个简单的代码行,
DIR = 'path/to/test.vcf'
for line in open(DIR):
column = line.split()
print column[2]
列输出:
['chr1', '19964150', '.', 'AAAAGAAAAAGAAAAAGAA', '.', '0', '.','END=19964169;MOTIF=AAAAAG;REF=3.16667;RL=19;RPA=.;RU=AAAAGA;VT=STR', 'GT:ALLREADS:AML:DP:GB:PL:Q:STITCH', '0/0:0|6:1/1:6:0/0:0:1:1']
列[0]输出:
chr1
但是任何其他整数索引都会给我一个错误 如果列是一个包含10 [9 by list logic]拆分字符串的列表,为什么我会收到此错误?
答案 0 :(得分:3)
应该有与您的期望不符的行。 (行数较少/空行)。
保护访问第三列的行以避免异常。
DIR = 'path/to/test.vcf'
for line in open(DIR):
column = line.split()
if len(column) > 2:
print column[2]