numpy有效地计算多项式

时间:2014-06-05 16:53:14

标签: python numpy performance polynomials

我正在尝试使用numpy来评估多项式(3度)。 我发现通过更简单的python代码来实现它会更有效率。

import numpy as np
import timeit

m = [3,7,1,2]

f = lambda m,x: m[0]*x**3 + m[1]*x**2 + m[2]*x + m[3]
np_poly = np.poly1d(m)
np_polyval = lambda m,x: np.polyval(m,x)
np_pow = lambda m,x: np.power(x,[3,2,1,0]).dot(m)

print 'result={}, timeit={}'.format(f(m,12),timeit.Timer('f(m,12)', 'from __main__   import f,m').timeit(10000))
result=6206, timeit=0.0036780834198

print 'result={}, timeit={}'.format(np_poly(12),timeit.Timer('np_poly(12)', 'from __main__ import np_poly').timeit(10000))
result=6206, timeit=0.180546045303

print 'result={}, timeit={}'.format(np_polyval(m,12),timeit.Timer('np_polyval(m,12)', 'from __main__ import np_polyval,m').timeit(10000))
result=6206, timeit=0.227771043777

print 'result={}, timeit={}'.format(np_pow(m,12),timeit.Timer('np_pow(m,12)', 'from __main__ import np_pow,m').timeit(10000))
result=6206, timeit=0.168987989426

我错过了什么吗?

numpy中还有另一种评估多项式的​​方法吗?

2 个答案:

答案 0 :(得分:7)

像23年前那样我从大学图书馆查看了一份Press等人的 Numerical Recipes in C 。那本书里有很多很酷的东西,但多年来一直困扰着我的一段话,page 173 here

  

我们假设您知道的永远不会评估多项式   方式:

    p=c[0]+c[1]*x+c[2]*x*x+c[3]*x*x*x+c[4]*x*x*x*x;
     

或(更糟糕的是!),

    p=c[0]+c[1]*x+c[2]*pow(x,2.0)+c[3]*pow(x,3.0)+c[4]*pow(x,4.0);
     

来(计算机)革命,所有人都被判有罪   犯罪行为将被立即执行,他们的计划不会被取消   是!然而,这是一个品味问题,是否写作

    p = c[0]+x*(c[1]+x*(c[2]+x*(c[3]+x*c[4])));
     

    p = (((c[4]*x+c[3])*x+c[2])*x+c[1])*x+c[0];

因此,如果你真的担心性能,你想尝试一下,对于更高次多项式的差异将是巨大的:

In [24]: fast_f = lambda m, x: m[3] + x*(m[1] + x*(m[2] + x*m[3]))

In [25]: %timeit f(m, 12)
1000000 loops, best of 3: 478 ns per loop

In [26]: %timeit fast_f(m, 12)
1000000 loops, best of 3: 374 ns per loop

如果你想坚持numpy,有一个更新的多项式类比我的系统上的poly1d运行速度快2倍,但仍比前面的循环慢得多:

In [27]: np_fast_poly = np.polynomial.polynomial.Polynomial(m[::-1])

In [28]: %timeit np_poly(12)
100000 loops, best of 3: 15.4 us per loop

In [29]: %timeit np_fast_poly(12)
100000 loops, best of 3: 8.01 us per loop

答案 1 :(得分:1)

好吧,看看polyval的实现(这是当你评估poly1d时最终被调用的函数),实现者决定包含一个显式循环似乎很奇怪......来自numpy 1.6的源代码0.2:

def polyval(p, x):
    p = NX.asarray(p)
    if isinstance(x, poly1d):
        y = 0
    else:
        x = NX.asarray(x)
        y = NX.zeros_like(x)
    for i in range(len(p)):
        y = x * y + p[i]
    return y

一方面,避免电源操作应该是速度方面的优势,另一方面,python级别的循环几乎搞砸了。

这是一个替代的numpy-ish实现:

POW = np.arange(100)[::-1]
def g(m, x):
    return np.dot(m, x ** POW[m.size : ])

为了提高速度,我避免在每次通话时重新创建电源阵列。另外,为了公平地对numpy进行基准测试时,你应该从numpy数组开始,而不是列表,以避免在每次调用时将列表转换为numpy的惩罚。

因此,在添加m = np.array(m)时,我的g只会比您的f慢约50%。

尽管你发布的例子比较慢,但是为了评估标量x上的低次多项式,你实际上不能比明确的实现(比如你的f)快得多()当然你可以,但可能没有那么多,如果不求助于编写低级代码)。但是,对于更高的学位(你必须用某种循环替换你的表达式),numpy方法(例如g)会随着程度的增加而更快地被证明,也适用于矢量化评估,即x是一个向量。