如何将多个文本文件读入单个RDD?

时间:2014-06-04 05:43:34

标签: apache-spark

我想从hdfs位置读取一堆文本文件,并使用spark在迭代中对其执行映射。

JavaRDD<String> records = ctx.textFile(args[1], 1);一次只能读取一个文件。

我想读取多个文件并将它们作为单个RDD处理。怎么样?

10 个答案:

答案 0 :(得分:274)

您可以指定整个目录,使用通配符甚至CSV目录和通配符。 E.g:

sc.textFile("/my/dir1,/my/paths/part-00[0-5]*,/another/dir,/a/specific/file")

正如Nick Chammas所指出的,这是Hadoop FileInputFormat的曝光,因此这也适用于Hadoop(和Scalding)。

答案 1 :(得分:31)

使用union,如下所示:

val sc = new SparkContext(...)
val r1 = sc.textFile("xxx1")
val r2 = sc.textFile("xxx2")
...
val rdds = Seq(r1, r2, ...)
val bigRdd = sc.union(rdds)

然后bigRdd是包含所有文件的RDD。

答案 2 :(得分:26)

您可以使用单个textFile调用来读取多个文件。阶:

sc.textFile(','.join(files)) 

答案 3 :(得分:8)

您可以使用此

首先,您可以获得S3路径的缓冲区/列表:

import scala.collection.JavaConverters._
import java.util.ArrayList
import com.amazonaws.services.s3.AmazonS3Client
import com.amazonaws.services.s3.model.ObjectListing
import com.amazonaws.services.s3.model.S3ObjectSummary
import com.amazonaws.services.s3.model.ListObjectsRequest

def listFiles(s3_bucket:String, base_prefix : String) = {
    var files = new ArrayList[String]

    //S3 Client and List Object Request
    var s3Client = new AmazonS3Client();
    var objectListing: ObjectListing = null;
    var listObjectsRequest = new ListObjectsRequest();

    //Your S3 Bucket
    listObjectsRequest.setBucketName(s3_bucket)

    //Your Folder path or Prefix
    listObjectsRequest.setPrefix(base_prefix)

    //Adding s3:// to the paths and adding to a list
    do {
      objectListing = s3Client.listObjects(listObjectsRequest);
      for (objectSummary <- objectListing.getObjectSummaries().asScala) {
        files.add("s3://" + s3_bucket + "/" + objectSummary.getKey());
      }
      listObjectsRequest.setMarker(objectListing.getNextMarker());
    } while (objectListing.isTruncated());

    //Removing Base Directory Name
    files.remove(0)

    //Creating a Scala List for same
    files.asScala
  }

现在将此List对象传递给以下代码段,注意:sc是SQLContext的对象

var df: DataFrame = null;
  for (file <- files) {
    val fileDf= sc.textFile(file)
    if (df!= null) {
      df= df.unionAll(fileDf)
    } else {
      df= fileDf
    }
  }

现在你有一个最终的统一RDD,即df

可选,您也可以在一个BigRDD

中重新分区
val files = sc.textFile(filename, 1).repartition(1)

重新分区始终有效:D

答案 4 :(得分:3)

在PySpark中,我找到了另一种解析文件的有用方法。也许在Scala中有一个等价物,但我不太满意于提出一个有效的翻译。它实际上是一个带有标签的textFile调用(在下面的例子中,key = filename,value =来自文件的1行)。

“标签”textFile

输入:

import glob
from pyspark import SparkContext
SparkContext.stop(sc)
sc = SparkContext("local","example") # if running locally
sqlContext = SQLContext(sc)

for filename in glob.glob(Data_File + "/*"):
    Spark_Full += sc.textFile(filename).keyBy(lambda x: filename)

output:数组,每个条目包含一个使用filename-as-key并且value =每行文件的元组。 (从技术上讲,使用此方法,您还可以使用除实际文件路径名称之外的其他键 - 可能是哈希表示以节省内存)。即。

[('/home/folder_with_text_files/file1.txt', 'file1_contents_line1'),
 ('/home/folder_with_text_files/file1.txt', 'file1_contents_line2'),
 ('/home/folder_with_text_files/file1.txt', 'file1_contents_line3'),
 ('/home/folder_with_text_files/file2.txt', 'file2_contents_line1'),
  ...]

您还可以重新组合作为一系列行:

Spark_Full.groupByKey().map(lambda x: (x[0], list(x[1]))).collect()

[('/home/folder_with_text_files/file1.txt', ['file1_contents_line1', 'file1_contents_line2','file1_contents_line3']),
 ('/home/folder_with_text_files/file2.txt', ['file2_contents_line1'])]

或者将整个文件重新组合回单个字符串(在此示例中,结果与从wholeTextFiles获得的结果相同,但是从文件路径中删除字符串“file:”。):

Spark_Full.groupByKey().map(lambda x: (x[0], ' '.join(list(x[1])))).collect()

答案 5 :(得分:3)

你可以使用

JavaRDD<String , String> records = sc.wholeTextFiles("path of your directory")

在这里,您将获得文件的路径和该文件的内容。所以你可以一次执行整个文件的任何操作,节省开销

答案 6 :(得分:2)

sc.textFile

的所有答案都是正确的

我只是想知道为什么不wholeTextFiles例如,在这种情况下......

val minPartitions = 2
val path = "/pathtohdfs"
    sc.wholeTextFiles(path,minPartitions)
      .flatMap{case (path, text) 
    ...

一个限制是,我们必须加载小文件,否则性能会很差并且可能导致OOM。

注意:

  • 整个文件应该适合内存
  • 适用于不能按行分割的文件格式...例如XML文件

进一步参考visit

答案 7 :(得分:1)

有一种直接的清洁解决方案。使用wholeTextFiles()方法。这将获取一个目录并形成一个键值对。返回的RDD将是一对RDD。 在Spark docs

下面找到说明
  

SparkContext.wholeTextFiles允许您读取包含多个小文本文件的目录,并将每个文件作为(文件名,内容)对返回。这与textFile形成对比,textFile将在每个文件中每行返回一条记录

答案 8 :(得分:0)

尝试 用于将DataFrame写入外部存储系统(例如文件系统,键值存储等)的接口。使用DataFrame.write()来访问它。

1.4版的新功能。

csv(path,mode = None,compression = None,sep = None,quote = None,escape = None,header = None,nullValue = None,escapeQuotes = None,quoteAll = None,dateFormat = None,timestampFormat = None ) 在指定路径下以CSV格式保存DataFrame的内容。

参数: path –任何Hadoop支持的文件系统中的路径 模式– 指定当数据已经存在时保存操作的行为。

追加:将此DataFrame的内容追加到现有数据。 覆盖:覆盖现有数据。 忽略:如果数据已经存在,则静默忽略此操作。 错误(默认情况):如果数据已经存在,则引发异常。 压缩–保存到文件时使用的压缩编解码器。这可以是已知的不区分大小写的缩写名称(none,bzip2,gzip,lz4,snappy和deflate)。 sep –将单个字符设置为每个字段和值的分隔符。如果设置为None,则使用默认值.。 quote –设置用于转义带引号的值的单个字符,其中分隔符可以是值的一部分。如果设置为None,则使用默认值“。如果要关闭引号,则需要设置一个空字符串。 转义-设置用于在已加引号的值内转义引号的单个字符。如果设置为None,则使用默认值\ escapeQuotes –一个标志,指示是否应始终将包含引号的值括在引号中。如果设置为None,它将使用默认值true,转义包含引号字符的所有值。 quoteAll –一个标志,指示是否应始终将所有值括在引号中。如果设置为None,它将使用默认值false,仅转义包含引号字符的值。 标头–将列名写为第一行。如果设置为None,则使用默认值false。 nullValue –设置空值的字符串表示形式。如果设置为None,它将使用默认值空字符串。 dateFormat –设置指示日期格式的字符串。自定义日期格式遵循java.text.SimpleDateFormat的格式。这适用于日期类型。如果设置为None,则使用默认值yyyy-MM-dd。 timestampFormat –设置指示时间戳格式的字符串。自定义日期格式遵循java.text.SimpleDateFormat的格式。这适用于时间戳类型。如果设置为None,它将使用默认值yyyy-MM-dd'T'HH:mm:ss.SSSZZ。

答案 9 :(得分:-3)

rdd = textFile('/data/{1.txt,2.txt}')