Knitr with gridSVG

时间:2014-05-25 06:44:26

标签: r knitr

有人在Knitr中使用gridSVG吗?我找到了包" gridSVG"提供一个名为" gridsvg"我编写的代码如下。

 ```{r message=FALSE, echo=FALSE, warning=FALSE, results='hide', dev='gridsvg', fig.ext='svg'}
analysis.runner.result.plot(result, score.table, info.table) # which produces a gpplot
```

当我点击" Knitr HTML"时,我得到了:

pandoc.exe: Could not find data file
AnalysisReport_files/figure-html/unnamed-chunk-61.svg pandoc document conversion failed

似乎gridsvg没有生成svg文件。我在互联网上搜索过但没有找到任何在knitr中使用gridSVG的例子。

我应该如何修改代码? (P.S.由于Windows下的渲染质量,我不想使用默认的“svg'设备”

谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:7)

由于gridSVG::gridsvg()不是标准R图形设备,因此您无法使用 knitr 中的dev块选项。目前唯一的方法是手动保存图,并使用块钩将图形写入输出(参见knitr graphics manual)。这是一个例子:

---
title: Save plots using gridSVG and knitr
author: Yihui Xie
output:
  html_document: default
---

Set up a chunk hook for manually saved plots.

```{r setup}
library(knitr)
knit_hooks$set(custom.plot = hook_plot_custom)
```

A single plot.

```{r test-a, fig.keep='none', fig.ext='svg', custom.plot=TRUE}
library(ggplot2)
qplot(speed, dist, data = cars)
gridSVG::grid.export(fig_path('.svg'))
```

Multiple plots.

```{r test-b, fig.keep='none', fig.ext='svg', custom.plot=TRUE, fig.num=2, message=FALSE}
library(ggplot2)
p = qplot(speed, dist, data = cars)
p + geom_smooth()
gridSVG::grid.export(fig_path('svg', number = 1))
p + geom_jitter()
gridSVG::grid.export(fig_path('svg', number = 2))
```

See the source document of this post at
http://stackoverflow.com/q/23852753/559676

请参阅http://rpubs.com/yihui/knitr-gridsvg

的输出