c#:如何读取文件的部分? (DICOM)

时间:2010-03-04 19:07:08

标签: c# file-io dicom

我想在C#中读取DICOM文件。我不想做任何花哨的事情,我现在只想知道如何读取元素,但首先我实际上想知道如何读取标题以查看是否是有效的DICOM文件< / em>的

它由二进制数据元素组成。前128个字节未使用(设置为零),后跟字符串'DICM'。接下来是标题信息,它被组织成组。

示例DICOM标题

First 128 bytes: unused DICOM format.
Followed by the characters 'D','I','C','M'
Followed by extra header information such as:

0002,0000, File Meta Elements Groups Len: 132
0002,0001, File Meta Info Version: 256
0002,0010, Transfer Syntax UID: 1.2.840.10008.1.2.1.
0008,0000, Identifying Group Length: 152
0008,0060, Modality: MR
0008,0070, Manufacturer: MRIcro

在上面的示例中,标题被组织成组。组0002十六进制是文件元信息组,包含3个元素:一个定义组长度,一个存储文件版本,它们存储传输语法。

问题

  • 如何通过检查128字节前导后的'D','I','C','M'字符来读取头文件并验证它是否是DICOM文件?
  • 如何继续解析读取数据其他部分的文件?

6 个答案:

答案 0 :(得分:11)

这样的东西应该读取文件,它是基本的,并不处理所有情况,但它将是一个起点:


public void ReadFile(string filename)
{
    using (FileStream fs = File.OpenRead(filename))
    {
        fs.Seek(128, SeekOrigin.Begin);
        if (!(fs.ReadByte() != (byte)'D' ||
              fs.ReadByte() != (byte)'I' ||
              fs.ReadByte() != (byte)'C' ||
              fs.ReadByte() != (byte)'M'))
        {
            Console.WriteLine("Not a DCM");
            return;
        }
        BinaryReader reader = new BinaryReader(fs);

        ushort g;
        ushort e;
        do
        {
            g = reader.ReadUInt16();
            e = reader.ReadUInt16();

            string vr = new string(reader.ReadChars(2));
            long length;
            if (vr.Equals("AE") || vr.Equals("AS") || vr.Equals("AT")
                || vr.Equals("CS") || vr.Equals("DA") || vr.Equals("DS")
                || vr.Equals("DT") || vr.Equals("FL") || vr.Equals("FD")
                || vr.Equals("IS") || vr.Equals("LO") || vr.Equals("PN")
                || vr.Equals("SH") || vr.Equals("SL") || vr.Equals("SS")
                || vr.Equals("ST") || vr.Equals("TM") || vr.Equals("UI")
                || vr.Equals("UL") || vr.Equals("US"))
               length = reader.ReadUInt16();
            else
            {
                // Read the reserved byte
                reader.ReadUInt16();
                length = reader.ReadUInt32();
            }

            byte[] val = reader.ReadBytes((int) length);

        } while (g == 2);

        fs.Close();
    }

    return ;
}

代码实际上没有尝试并考虑到编码数据的传输语法可以在组2元素之后改变,它也不会尝试对读入的实际值做任何事情。

答案 1 :(得分:4)

快速Google search提出了三个DICOM C#库:

答案 2 :(得分:1)

答案 3 :(得分:1)

只是一些假的

如何通过检查128字节前导后的'D','I','C','M'字符来读取头文件并验证它是否是DICOM文件?

  • 使用File.OpenRead
  • 以二进制文件打开
  • 寻找位置128并将4个字节读入数组并再次比较DICM的byte []值。您可以使用ASCIIEncoding.GetBytes()

如何继续解析读取数据其他部分的文件?

  • 使用您之前使用的FileStream对象句柄继续使用Read或ReadByte读取文件
  • 使用与上述相同的方法进行比较。

别忘了关闭并处理该文件。

答案 4 :(得分:0)

你也可以这样使用。

FileStream fs = File.OpenRead(path);

byte[] data = new byte[132];
fs.Read(data, 0, data.Length);

int b0 = data[0] & 255, b1 = data[1] & 255, b2 = data[2] & 255, b3 = data[3] & 255;

if (data[128] == 68 && data[129] == 73 && data[130] == 67 && data[131] == 77)
        {
           //dicom file
        }
        else if ((b0 == 8 || b0 == 2) && b1 == 0 && b3 == 0)
        {
            //dicom file
        }

答案 5 :(得分:0)

取自Evil Dicom图书馆的EvilDicom.Helper.DicomReader:

 public static bool IsValidDicom(BinaryReader r)
    {
        try
        {
            //128 null bytes
            byte[] nullBytes = new byte[128];
            r.Read(nullBytes, 0, 128);
            foreach (byte b in nullBytes)
            {
                if (b != 0x00)
                {
                    //Not valid
                    Console.WriteLine("Missing 128 null bit preamble. Not a valid DICOM file!");
                    return false;
                }
            }
        }
        catch (Exception)
        {

            Console.WriteLine("Could not read 128 null bit preamble. Perhaps file is too short");
            return false;
        }

        try
        {
            //4 DICM characters
            char[] dicm = new char[4];
            r.Read(dicm, 0, 4);
            if (dicm[0] != 'D' || dicm[1] != 'I' || dicm[2] != 'C' || dicm[3] != 'M')
            {
                //Not valid
                Console.WriteLine("Missing characters D I C M in bits 128-131. Not a valid DICOM file!");
                return false;
            }
            return true;

        }
        catch (Exception)
        {

            Console.WriteLine("Could not read DICM letters in bits 128-131.");
            return false;
        }

    }