pandas应用函数将多个值返回到pandas dataframe中的行

时间:2014-05-15 23:21:04

标签: python pandas

我有一个带有timeindex的数据框和包含3D矢量坐标的3列:

                         x             y             z
ts
2014-05-15 10:38         0.120117      0.987305      0.116211
2014-05-15 10:39         0.117188      0.984375      0.122070
2014-05-15 10:40         0.119141      0.987305      0.119141
2014-05-15 10:41         0.116211      0.984375      0.120117
2014-05-15 10:42         0.119141      0.983398      0.118164

我想对每个也返回向量

的行应用转换
def myfunc(a, b, c):
    do something
    return e, f, g

但如果我这样做:

df.apply(myfunc, axis=1)

我最终得到了一个Pandas系列,其元素是元组。这是因为申请将取得myfunc的结果而不解压缩它。如何更改myfunc以便我获得一个包含3列的新df?

修改

以下所有解决方案均可使用。 Series系列解决方案允许列名称,List解决方案似乎执行得更快。

def myfunc1(args):
    e=args[0] + 2*args[1]
    f=args[1]*args[2] +1
    g=args[2] + args[0] * args[1]
    return pd.Series([e,f,g], index=['a', 'b', 'c'])

def myfunc2(args):
    e=args[0] + 2*args[1]
    f=args[1]*args[2] +1
    g=args[2] + args[0] * args[1]
    return [e,f,g]

%timeit df.apply(myfunc1 ,axis=1)

100 loops, best of 3: 4.51 ms per loop

%timeit df.apply(myfunc2 ,axis=1)

100 loops, best of 3: 2.75 ms per loop

7 个答案:

答案 0 :(得分:34)

返回Series,它会将它们放入DataFrame。

def myfunc(a, b, c):
    do something
    return pd.Series([e, f, g])

这样可以为每个结果列提供标签。如果您返回一个DataFrame,它只会为该组插入多行。

答案 1 :(得分:14)

基于@ U2EF1的优秀answer,我创建了一个方便的函数,它应用指定的函数将元组返回到数据帧字段,并将结果扩展回数据帧。

def apply_and_concat(dataframe, field, func, column_names):
    return pd.concat((
        dataframe,
        dataframe[field].apply(
            lambda cell: pd.Series(func(cell), index=column_names))), axis=1)

用法:

df = pd.DataFrame([1, 2, 3], index=['a', 'b', 'c'], columns=['A'])
print df
   A
a  1
b  2
c  3

def func(x):
    return x*x, x*x*x

print apply_and_concat(df, 'A', func, ['x^2', 'x^3'])

   A  x^2  x^3
a  1    1    1
b  2    4    8
c  3    9   27

希望它有所帮助。

答案 2 :(得分:7)

只需返回一个列表而不是元组。

In [81]: df
Out[81]: 
                            x         y         z
ts                                               
2014-05-15 10:38:00  0.120117  0.987305  0.116211
2014-05-15 10:39:00  0.117188  0.984375  0.122070
2014-05-15 10:40:00  0.119141  0.987305  0.119141
2014-05-15 10:41:00  0.116211  0.984375  0.120117
2014-05-15 10:42:00  0.119141  0.983398  0.118164

[5 rows x 3 columns]

In [82]: def myfunc(args):
   ....:        e=args[0] + 2*args[1]
   ....:        f=args[1]*args[2] +1
   ....:        g=args[2] + args[0] * args[1]
   ....:        return [e,f,g]
   ....: 

In [83]: df.apply(myfunc ,axis=1)
Out[83]: 
                            x         y         z
ts                                               
2014-05-15 10:38:00  2.094727  1.114736  0.234803
2014-05-15 10:39:00  2.085938  1.120163  0.237427
2014-05-15 10:40:00  2.093751  1.117629  0.236770
2014-05-15 10:41:00  2.084961  1.118240  0.234512
2014-05-15 10:42:00  2.085937  1.116202  0.235327

答案 3 :(得分:6)

其他人的一些答案包含错误,所以我在下面总结了它们。完美答案如下。

准备数据集。 pandas 的版本使用 1.1.5

import numpy as np
import pandas as pd
import timeit

# check pandas version
print(pd.__version__)
# 1.1.5

# prepare DataFrame
df = pd.DataFrame({
    'x': [0.120117, 0.117188, 0.119141, 0.116211, 0.119141],
    'y': [0.987305, 0.984375, 0.987305, 0.984375, 0.983398],
    'z': [0.116211, 0.122070, 0.119141, 0.120117, 0.118164]},
    index=[
        '2014-05-15 10:38',
        '2014-05-15 10:39',
        '2014-05-15 10:40',
        '2014-05-15 10:41',
        '2014-05-15 10:42'],
    columns=['x', 'y', 'z'])
df.index.name = 'ts'
#                          x         y         z
# ts                                            
# 2014-05-15 10:38  0.120117  0.987305  0.116211
# 2014-05-15 10:39  0.117188  0.984375  0.122070
# 2014-05-15 10:40  0.119141  0.987305  0.119141
# 2014-05-15 10:41  0.116211  0.984375  0.120117
# 2014-05-15 10:42  0.119141  0.983398  0.118164

解决方案 01。

在应用函数中返回 pd.Series

def myfunc1(args):
    e = args[0] + 2*args[1]
    f = args[1]*args[2] + 1
    g = args[2] + args[0] * args[1]
    return pd.Series([e, f, g])

df[['e', 'f', 'g']] = df.apply(myfunc1, axis=1)
#                          x         y         z         e         f         g
# ts
# 2014-05-15 10:38  0.120117  0.987305  0.116211  2.094727  1.114736  0.234803
# 2014-05-15 10:39  0.117188  0.984375  0.122070  2.085938  1.120163  0.237427
# 2014-05-15 10:40  0.119141  0.987305  0.119141  2.093751  1.117629  0.236770
# 2014-05-15 10:41  0.116211  0.984375  0.120117  2.084961  1.118240  0.234512
# 2014-05-15 10:42  0.119141  0.983398  0.118164  2.085937  1.116202  0.235327

t1 = timeit.timeit(
    'df.apply(myfunc1, axis=1)',
    globals=dict(df=df, myfunc1=myfunc1), number=10000)
print(round(t1, 3), 'seconds')
# 14.571 seconds

解决方案 02。

申请时使用result_type ='expand'

def myfunc2(args):
    e = args[0] + 2*args[1]
    f = args[1]*args[2] + 1
    g = args[2] + args[0] * args[1]
    return [e, f, g]

df[['e', 'f', 'g']] = df.apply(myfunc2, axis=1, result_type='expand')
#                          x         y         z         e         f         g
# ts                                                                          
# 2014-05-15 10:38  0.120117  0.987305  0.116211  2.094727  1.114736  0.234803
# 2014-05-15 10:39  0.117188  0.984375  0.122070  2.085938  1.120163  0.237427
# 2014-05-15 10:40  0.119141  0.987305  0.119141  2.093751  1.117629  0.236770
# 2014-05-15 10:41  0.116211  0.984375  0.120117  2.084961  1.118240  0.234512
# 2014-05-15 10:42  0.119141  0.983398  0.118164  2.085937  1.116202  0.235327

t2 = timeit.timeit(
    "df.apply(myfunc2, axis=1, result_type='expand')",
    globals=dict(df=df, myfunc2=myfunc2), number=10000)
print(round(t2, 3), 'seconds')
# 9.907 seconds

解决方案 03。

如果您想使其更快,请使用 np.vectorize。请注意,使用 np.vectorize 时 args 不能是单个参数。

def myfunc3(args0, args1, args2):
    e = args0 + 2*args1
    f = args1*args2 + 1
    g = args2 + args0 * args1
    return [e, f, g]

df[['e', 'f', 'g']] = pd.DataFrame(np.row_stack(np.vectorize(myfunc3, otypes=['O'])(df['x'], df['y'], df['z'])), index=df.index)
#                          x         y         z         e         f         g
# ts                                                                          
# 2014-05-15 10:38  0.120117  0.987305  0.116211  2.094727  1.114736  0.234803
# 2014-05-15 10:39  0.117188  0.984375  0.122070  2.085938  1.120163  0.237427
# 2014-05-15 10:40  0.119141  0.987305  0.119141  2.093751  1.117629  0.236770
# 2014-05-15 10:41  0.116211  0.984375  0.120117  2.084961  1.118240  0.234512
# 2014-05-15 10:42  0.119141  0.983398  0.118164  2.085937  1.116202  0.235327

t3 = timeit.timeit(
    "pd.DataFrame(np.row_stack(np.vectorize(myfunc3, otypes=['O'])(df['x'], df['y'], df['z'])), index=df.index)",
    globals=dict(pd=pd, np=np, df=df, myfunc3=myfunc3), number=10000)
print(round(t3, 3), 'seconds')
# 1.598 seconds

答案 4 :(得分:5)

我尝试返回一个元组(我正在使用scipy.stats.pearsonr之类的函数来返回这种结构),但是它返回了1D Series而不是我期望的Dataframe。如果我手动创建了一个Series,性能会更差,所以我按照official API documentation中的说明使用result_type对其进行了修复:

在函数内部返回Series类似于传递 result_type ='expand'。结果列名称将为Series 索引。

因此,您可以通过以下方式编辑代码:

def myfunc(a, b, c):
    # do something
    return (e, f, g)

df.apply(myfunc, axis=1,  result_type='expand')

答案 5 :(得分:3)

找到一个可能的解决方案,通过更改myfunc返回如下的np.array:

import numpy as np

def myfunc(a, b, c):
    do something
    return np.array((e, f, g))

任何更好的解决方案?

答案 6 :(得分:0)

Pandas 1.0.5具有DataFrame.apply,其参数为 result_type ,可在此处提供帮助。 来自文档:

These only act when axis=1 (columns):

‘expand’ : list-like results will be turned into columns.

 ‘reduce’ : returns a Series if possible rather than expanding list-like results. This 
 is the opposite of ‘expand’.

‘broadcast’ : results will be broadcast to the original shape of the DataFrame, the 
original index and columns will be retained.