在非常大的矩阵上调用Matplotlib的pcolormesh时内存不足

时间:2014-05-15 22:34:01

标签: python matplotlib scipy

我有一个非常大的稀疏矩阵:

In [10]: s.matrix
Out[10]:
<19242x19242 sparse matrix of type '<type 'numpy.int64'>'
    with 393555 stored elements in COOrdinate format>

我希望可视化矩阵以找到潜在的聚类。尝试通过以下方式在所述矩阵上运行plt.pcolormesh来生成热图时:

plt.pcolormesh(s.matrix.todense())

......我的内存不足。您对更有效的方法有什么建议吗?

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