以编程方式从不同的源文件中引出IPython笔记本输出单元

时间:2014-05-10 21:32:39

标签: python ipython ipython-notebook

假设有一个Python文件myfile.py。可以将文件的内容视为粘贴到IPython笔记本中的单个单元格中然后执行(并且应该在笔记本中生成任何生成的输出)。

是否有可能以编程方式导致这种情况发生?也就是说,我想调用类似“python myfile.py”的内容,结果是启动笔记本,弹出一个标签,仅输出myfile.py 产生的输出已经显示在笔记本中。

我特别希望避免将.py文件“变成笔记本”的情况,并且要执行的代码显示为输入单元格。

这个想法是为了调用这个.py文件来像web应用程序一样运行 - 所以输出应该只在笔记本中弹出。笔记本的内核应该仍在运行,如果有交互性必须从.py文件发回回代码。

每一件作品似乎都已经存在于IPython中(交互式小部件,转换为笔记本,甚至只是使用Popen来启动笔记本) - 但目前还不清楚如何从普通的.py文件中启动只有输出的方式出现。

这是一次尝试:

import sys
import subprocess
from IPython.nbformat import current as nbf

# Parse the output cell needed from the file
py_file_name = sys.argv[1] 
with open(py_file_name, 'r') as py_file:
    py_code = py_file.read()

# Set an input cell and invoke it.
nb = nbf.new_notebook()
cells = [nbf.new_code_cell(py_code)]
nb['worksheets'].append(nbf.new_worksheet(cells=cells))

# Store the result into a notebook.
notebook_name = py_file_name + '.ipynb'
with open(notebook_name, 'w') as f:
    nbf.write(nb, f, 'ipynb')

# Launch a new IPython notebook kernel
subprocess.call(["ipython", "-c", "'%run {}'".format(notebook_name)])

这不太理想 - 因为它仍然需要我填充单元格的输入部分,然后实际打开文件并执行它。

即便如此,当我在底部使用%run选项时出现错误,如下所示:

ely@eschaton:~$ python launcher.py myfile1.py
---------------------------------------------------------------------------
NameError                                 Traceback (most recent call last)
/home/ely/anaconda/lib/python2.7/site-packages/IPython/utils/py3compat.pyc in execfile(fname, *where)
    202             else:
    203                 filename = fname
--> 204             __builtin__.execfile(filename, *where)

/home/ely/myfile1.py.ipynb in <module>()
      8     {
      9      "cell_type": "code",
---> 10      "collapsed": false,
     11      "input": [
     12       "import numpy as np\n",

NameError: name 'false' is not defined

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

只是删除anaconda,不知何故它导致了这个问题。要删除它,只需执行rm -rf ~/anaconda并再次尝试执行%run(假设您拥有所有pandas / ipython要求)