如何优化MATLAB循环？

Question

我最近一直在使用MATLAB中的一些迭代算法，并且在涉及循环时，MATLAB的性能（或缺乏性能）受到了很大的打击。我知道在可能的情况下矢量化代码的好处，但是当你需要算法循环时，是否有任何优化工具？

我知道在C / C ++中编写小子程序的MEX文件选项，虽然考虑到我的算法，但考虑到所需的数据结构，这可能是一个非常痛苦的选择。我主要使用MATLAB来实现原型的简单性和速度，因此语法复杂的静态类型语言对我的情况并不理想。

还有其他建议吗？甚至其他语言（python？）也有相对无痛的矩阵工具。

Answer 1

PROFILER是一个非常有用的工具，可以找到Matlab代码中的瓶颈。它当然不会改变你的代码，但有助于找到用矢量化或mex优化的函数/行。

http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/techdoc/ref/profile.html

http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/techdoc/matlab_env/f9-17018.html

Answer 2

曾经的确，矢量化会提高MATLAB代码的速度。但是，JIT-accelerator

在很大程度上已不再适用

这video demonstrating the MATLAB profiler可能会有所帮助。

Answer 3

您可能想要研究MATLAB的并行计算工具箱，如果您拥有合适的硬件，它可以产生很大的不同。我重新编写了大约12行代码，并为我们的一个循环密集型程序和八个核心PC加速了4-6倍。

Answer 4

如果您有选择，请务必设置循环，以便逐列扫描数据，这是MATLAB中数据的排列方式。另外，确保在循环之前预先分配任何输出数组并将其索引到它们中，而不是在for循环中增长数组。

Answer 5

如果您可以转换代码以便在整个矩阵上调用您的操作，那么您将看到代码速度的显着提高。在整个矩阵上运行时，许多函数要快得多，而不是以循环的元素方式运行。