Question

这是我的第一个堆栈溢出问题所以请原谅我对论坛的任何无知。

我在win 7机器上使用来自Enthought Canopy 1.3.0.1715的python 2.7.6 64位和pandas 0.13.1-1。我有numpy 1.8.0-1和numexpr 2.2.2-2。

我在从hdf加载的10,000个numpy.float64的pandas系列中运行以下内容时出现了不一致的错误：

import python
s = pandas.read_hdf(r'C:\test\test.h5', 'test')
s/2.

这给了我不一致的行为，它有时会起作用，有时会抛出：

OMP: Error #134: Cannot set thread affinity mask.
OMP: System error #87: The parameter is incorrect.

我在其他计算机上复制了此错误，并且测试用例来自单元测试失败（带有上述错误），该错误在多台计算机和服务器上复制。这已经从熊猫0.12升级到熊猫0.13。

以下一致运行，没有错误：

import python
s = pandas.read_hdf(r'C:\test\test.h5', 'test')
s.apply(lambda x: x/2.)

和

import python
s = pandas.read_hdf(r'C:\test\test.h5', 'test')
pandas.computation.expressions.set_use_numexpr(False)
s/2.

感谢您的帮助。

Answer 1

这是与此issue中描述的非常类似的问题，以及链接的issue

似乎只有canopy遇到了这些问题。我认为它与冠层numpy MKL构建有关，但这是猜测，因为我无法重现这一点。所以这里有一些解决方法：

尝试将numexpr升级到2.4（当前版本），或降级为2.1
尝试通过冠层使用numpy 1.8.1
尝试从发布的二进制文件here安装numpy / numexpr;我不确切知道如何运作，所以不确定这是否可行
卸载numexpr

您还可以通过numexpr停用pandas.computation.expressions.set_use_numexpr(False)支持。请注意，numexpr是必需的，以便通过PyTables读取/使用HDF5文件。但是，禁用numexpr的表达式应该只是禁用它来进行计算＆＃39; （而不是HDF访问）。

pandas 0.13系统错误：无法设置线程关联掩码

1 个答案: