编辑：我设法通过proc_open（）打印出stderr然后使用那里的信息进行调试来实现这一点。
这是我的第一个问题，所以如果格式不正确，我会道歉。
我正在尝试通过浏览器中的php运行以下命令：
git init
git add *
git commit -a -m "commit message 01"
页面的网址是 本地主机/ jbrowse / testingphp / phpInsteadOfPerl.php
我在我的脚本中尝试了以下内容： passthru（），shell_exec（），exec（），system（）
############using passthru############
passthru('git init');
passthru('git add *');
passthru('git commit -a -m "commit message 01"');
将此打印到浏览器： 在/Library/WebServer/Documents/jbrowse/testingphp/.git /
中重新初始化现有的Git存储库############using shell_exec()############
$one = shell_exec('git init');
$two = shell_exec('git add *');
$three = shell_exec('git commit -a -m "commit message 01"');
echo "$one";
echo "$two";
echo "$three";
将此打印到浏览器： 在/Library/WebServer/Documents/jbrowse/testingphp/.git /
中重新初始化现有的Git存储库############using exec()############
$one = exec('git init', $oneOutput, $oneReturn);
$two = exec('git add *', $twoOutput, $twoReturn);
$three = exec('git commit -a -m "commit message 01"', $threeOutput, $threeReturn);
echo "one: $one";
echo "two: $two";
echo "three: $three";
echo "<br>";
echo "oneOutput: ";
echo join($oneOutput);
echo "twoOutput: ";
echo join($twoOutput);
echo "threeOutput: ";
echo join($threeOutput);
echo "<br>";
echo "oneReturn: $oneReturn ";
echo "twoReturn: $twoReturn ";
echo "threeReturn: $threeReturn ";
给出： 一：在/Library/WebServer/Documents/jbrowse/testingphp/.git/two中重新初始化现有的Git存储库：三：
oneOutput：在/Library/WebServer/Documents/jbrowse/testingphp/.git/twoOutput中重新初始化现有的Git存储库：threeOutput：
oneReturn：0 twoReturn：0 threeReturn：128
128，根据以下链接，表示“退出的参数无效”http://www.linuxtopia.org/online_books/advanced_bash_scripting_guide/exitcodes.html
############using system()############
system('git init');
system('git add *');
system('git commit -a -m "commit message 01"');
给出： 在/Library/WebServer/Documents/jbrowse/testingphp/.git /
中重新初始化现有的Git存储库如果我从终端运行这些php脚本，所有git命令都可以完美执行。
我认为这可能是一个权限问题，因此我已经为所有用户提供了对/ testingphp和/.git文件夹中所有内容的完全权限。 （当然.git文件夹的权限在重新初始化时会恢复为默认值，但是如果我取出代码的git init部分，那么它仍然无效。）
所有文件和目录的权限如下： （test001.sh是一个shell脚本，我将git命令放入其中并尝试通过php调用它。）
la-mckiernan:testingphp robertmckiernan$ ls -al
total 24
drwxrwxrwx 5 robertmckiernan wheel 170 6 May 14:45 .
drwxr-xrwx 24 robertmckiernan wheel 816 6 May 13:27 ..
drwxrwxrwx 13 robertmckiernan wheel 442 7 May 10:28 .git
-rwxrwxrwx@ 1 robertmckiernan wheel 2628 7 May 10:28 phpInsteadOfPerl.php
-rwxrwxrwx 1 robertmckiernan wheel 75 6 May 15:25 test001.sh
la-mckiernan:.git robertmckiernan$ ls -al
total 40
drwxrwxrwx 13 robertmckiernan wheel 442 7 May 10:28 .
drwxrwxrwx 5 robertmckiernan wheel 170 6 May 14:45 ..
-rwxrwxrwx 1 robertmckiernan wheel 6 6 May 16:50 COMMIT_EDITMSG
-rwxrwxrwx 1 robertmckiernan wheel 23 6 May 14:45 HEAD
drwxrwxrwx 2 _www wheel 68 6 May 16:34 branches
-rwxrwxrwx 1 _www wheel 137 7 May 10:28 config
-rwxrwxrwx 1 robertmckiernan wheel 73 6 May 14:45 description
drwxrwxrwx 11 robertmckiernan wheel 374 6 May 14:45 hooks
-rwxrwxrwx 1 _www wheel 214 7 May 10:28 index
drwxrwxrwx 3 robertmckiernan wheel 102 6 May 14:45 info
drwxrwxrwx 4 robertmckiernan wheel 136 6 May 14:45 logs
drwxrwxrwx 44 robertmckiernan wheel 1496 7 May 10:27 objects
drwxrwxrwx 4 robertmckiernan wheel 136 6 May 14:45 refs
我正在使用mac OSX mavericks。