Question

我在安装某些内容时遇到了困难，并希望编写一份我所做的详细列表（包括所有路径，因为我是Linux的新手，除非列出完整路径，否则读取内容时会遇到问题）

1）我正在尝试运行名为＆＃34; pslToBed ＆＃34;的程序。我从这里下载了它（http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/）。

2）它下载了一个名为＆＃34; pslToBed＆＃34;的文件。它看起来像一个二进制文件（至少都是乱码），我保存到目录/Users/MacOwner/Desktop/rnaseq/pslToBed

3）我做了echo $PATH，得到了以下

/usr/local/bin:/Users/MacOwner/anaconda/bin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin:/usr/local/bin:/usr/local/git/bin:/usr/texbin:/usr/X11/bin:/opt/local/bin:~/bin:/Users/MacOwner/Desktop/bedtools2-2.19.1

4）我从步骤（3）中选择了一条路径，即/usr/local/bin

5）我做了：cp /Users/MacOwner/Desktop/rnaseq/pslToBed /usr/local/bin/

6）我在〜/ .bashrc 和〜。/ bash_profile 的底部添加了相同的行： export PATH=$PATH:/usr/local/bin/pslToBed

然后，我返回/Users/MacOwner/Desktop/rnaseq/并尝试运行pslToBed，但收到错误-bash: /usr/local/bin/pslToBed: cannot execute binary file

我知道对于有经验的用户来说这可能是直截了当的，但即使在互联网上搜索了好几个小时之后，我仍然感到困惑。我的路径和想法看起来是否正确？如果没有，我该怎么做才能让这个程序运行？

Answer 1

首先，查看您拥有的文件类型：

file plsToBed

这将打印文件类型（包括有关目标体系结构的详细信息）。

接下来，在尝试运行文件之前，无需将文件复制到任何位置。如果它位于特定位置，并且您有cd到该位置，则只需：

./plsToBed

将从当前目录执行它。

你不应该在没有root的情况下复制到/usr/local/bin（我希望你不是以root身份完成所有这些）。

您不希望将文件名称添加到PATH环境变量中; PATH是目录的列表，而不是文件。

Bash：无法执行二进制文件（按照在线指示）

1 个答案: