我使用scikit-learn
来训练一些分类器。我做交叉验证,然后计算AUC。但是,每次运行测试时,我都会获得不同的AUC编号,尽管我确保使用种子和RandomState
。我希望我的测试是确定性的。这是我的代码:
from sklearn.utils import shuffle
SEED = 0
random_state = np.random.RandomState(SEED)
X, y = shuffle(data, Y, random_state=random_state)
X_train, X_test, y_train, y_test = \
cross_validation.train_test_split(X, y, test_size=test_size, random_state=random_state)
clf = linear_model.LogisticRegression()
kfold = cross_validation.KFold(len(X), n_folds=n_folds)
mean_tpr = 0.0
mean_fpr = np.linspace(0, 1, 100)
for train, test in kfold:
probas_ = clf.fit(X[train], Y[train]).predict_proba(X[test])
fpr, tpr, thresholds = roc_curve(Y[test], probas_[:, 1])
mean_tpr += interp(mean_fpr, fpr, tpr)
mean_tpr[0] = 0.0
mean_tpr /= len(kfold)
mean_tpr[-1] = 1.0
mean_auc = auc(mean_fpr, mean_tpr)
我的问题: 1-我的代码中是否有错误导致每次运行时结果都不同? 2-是否存在使scikit确定性的全局方法?
修改
我刚试过这个:
test_size = 0.5
X = np.random.randint(10, size=(10,2))
Y = np.random.randint(2, size=(10))
SEED = 0
random_state = np.random.RandomState(SEED)
X_train, X_test, y_train, y_test = \
cross_validation.train_test_split(X, Y, test_size=test_size, random_state=random_state)
print X_train # I recorded the result
然后我做了:
X_train, X_test, y_train, y_test = \
cross_validation.train_test_split(X, Y, test_size=test_size, random_state=6) #notice the change in random_state
然后我做了:
X_train, X_test, y_train, y_test = \
cross_validation.train_test_split(X, Y, test_size=test_size, random_state=random_state)
print X_train #the result is different from the first one!!!!
正如你所看到的,虽然我使用了相同的random_state,但我得到了不同的结果!怎么解决这个问题?
答案 0 :(得分:4)
LogisticRegression
在内部使用随机性,并且有一个(未记录的,稍后会修复)random_state
参数。
没有全局设置随机状态的方法,因为遗憾的是LogisticRegression
上的随机状态和SVM代码只能以hacky方式设置。这是因为这段代码来自Liblinear和LibSVM,后者使用C标准库的rand
函数,并且不能以原则方式播种。
编辑以上情况属实,但可能不是导致问题的原因。您通过调用通过单个np.random.RandomState
线程,同时应传递相同的整数种子,以便于重现。