Question

所以我正在尝试编写一个bash脚本来检查数据集中的所有值是否都在平均值的某个范围内。

到目前为止：

    #!/bin/bash
cat massbuild.csv
while IFS=, read col1 col2
do
x=$(grep "$col2" $col1.pdb | grep "HETATM" | awk '{ sum += $7; n++ } END { if (n > 0) print sum / n; }')


i=$(grep "$col2" $col1.pdb | grep "HETATM" | awk '{print $7;}')


if $(($i > $[$x + 15])); then
echo "OUTSIDE THE RANGE!"
fi

done < massbuild.csv

到目前为止，我已将其分解为要测试的组件，并且已经发现x和i的值正确读取，但似乎将x添加到x，或者与i的比较不起作用。< / p>

我在网上看过，我很难过= /

Answer 1

这有帮助吗？

a=4; b=0; if [ "$a" -lt "$(( $b + 5 ))" ]; then echo "a < b + 5"; else echo "a >= b + 5"; fi

参考：http://www.tldp.org/LDP/abs/html/comparison-ops.html

Answer 2

如果没有样本输入和预期输出，我们只是在猜测，但是这可能是您脚本的正确起点（当然，未经测试，因为没有输入/输出）：

#!/bin/bash
awk -F, '
NR==FNR {
    file = $1 ".pdb"
    ARGV[ARGC] = file
    file2col2s[file] = (col1to2s[file] ? file2col2s[file] FS : "") $2
    next
}

FNR==1 { split(file2col2s[FILENAME],col2s) }

/HETATM/ {
    for (i=1;i in col2s;i++) {
        col2 = col2s[i]
        if ($0 ~ col2) {
            sum[FILENAME,col2] += $7
            cnt[FILENAME,col2]++
        }
    }
}

END {
    for (file in file2col2s) {
        split(file2col2s[file],col2s)
        for (i=1;i in col2s;i++) {
            col2 = col2s[i]
            print sum[file,col2]
            print cnt[file,col2]
        }
    }
}
' massbuild.csv

添加与＆gt; /＆lt;组合的变量测试BASH

2 个答案: