我试图分别对几个(实际上是几百个)组进行指标计数(不是所有组的所有组合)。我将通过简化示例演示它:
假设我有该数据集
data<-cbind(c(1,1,1,2,2,2)
,c(1,1,2,2,2,3)
,c(3,2,1,2,2,3))
> data
[,1] [,2] [,3]
[1,] 1 1 3
[2,] 1 1 2
[3,] 1 2 1
[4,] 2 2 2
[5,] 2 2 2
[6,] 2 3 3
和指标
some_indicator<-c(1,0,0,1,0,1)
然后我想运行没有循环(比如像列应用),比如
aggregate(some_indicator,list(data[,1]),sum)
aggregate(some_indicator,list(data[,2]),sum)
aggregate(some_indicator,list(data[,3]),sum)
将产生以下结果:
[,1] [,2] [,3]
[1,] 1 1 0
[2,] 2 1 1
[3,] 0 1 2
即。对于每列(值子集在列之间不会发生太大变化),按值计算指标并合并它。
目前我用循环列编写了它,但我需要更有效的方法,因为有很多列而且需要一个多小时。
提前致谢, 迈克尔。
答案 0 :(得分:4)
1)tapply tapply
的第一个参数是data
,每列都被some_indicator
替换。第二个参数表明我们希望按数据组和列号分组。
result <- tapply(replace(data, TRUE, some_indicator), list(data, col(data)), sum)
replace(unname(result), is.na(result), 0)
对于问题中显示的输入,最后一行给出:
[,1] [,2] [,3]
[1,] 1 1 0
[2,] 2 1 1
[3,] 0 1 2
1a)tapply 稍微长一点的tapply
解决方案如下。 fun
以列为参数,并使用tapply
将some_indicator
中的组与该列作为组进行求和;但是,不同的列可以在其中具有不同的组,以确保它们都具有相同的组(为了以后的对齐),我们实际按factor(x, levs)
分组。 sapply
将fun
应用于data
的每一列。需要as.data.frame
,因为data
是一个矩阵,因此sapply
将应用于每个元素,而不是每个列,如果我们将其应用于此。
levs <- levels(factor(data))
fun <- function(x) tapply(some_indicator, factor(x, levs), sum)
result <- sapply(as.data.frame(data), fun)
replace(unname(result), is.na(result), 0)
2)xtabs 这与tapply
解决方案非常相似。它确实具有以下优点:(1)sum
暗示xtabs
因此无需指定,并且(2)未填充的单元格填充0而不是NA,从而消除了替换的额外步骤NAs为0.另一方面,我们必须使用c
将公式的每个组成部分解释为一个向量,因为与tapply
不同,xtabs
公式将不接受矩阵:
result <- xtabs(c(replace(data, TRUE, some_indicator)) ~ c(data) + c(col(data)))
dimnames(result) <- NULL
对于问题中的数据,这给出了:
> result
[,1] [,2] [,3]
[1,] 1 1 0
[2,] 2 1 1
[3,] 0 1 2
已修订已修订tapply
解决方案,并添加了xtabs
解决方案。
答案 1 :(得分:1)
melt
来自&#34; reshape2&#34;有一种矩阵的方法,这在这里很有用。使用&#34; reshape2&#34;,解决方案可以像以下一样简单:
library(reshape2)
dcast(cbind(some_indicator, melt(data)),
value ~ Var2, value.var= "some_indicator",
fun.aggregate=sum)
# value 1 2 3
# 1 1 1 1 0
# 2 2 2 1 1
# 3 3 0 1 2
此答案假定您对melt
的{{1}}工作原理有一些先验知识,特别是它会创建一个三列matrix
,其中包含&#34; Var1&#34;表示data.frame
(或数字),&#34; Var2&#34;表示rownames
(或数字)和&#34;值&#34;表示colnames
。