你可以在fasta文件中插入非序列相关的注释吗?

时间:2014-04-29 09:29:09

标签: alignment sequence bioinformatics fasta

我想知道是否有人知道如何在fasta文件中添加评论。我尝试使用#字符,但它不适合对齐算法/软件。

谢谢,

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我通常发现没有评论。但是在wikipedia article中,它表示如果以>开头,您可以在;行之后添加评论。但我从来没有找到任何有这种表示法的人。

但我从来没有找到任何带注释的fasta文件。通常,标头或名称会获得此归因,因此> E.coli可以转换为> E.coli X43 methanol,因为您可以看到here 但通常情况下,如here所示,here被添加为描述。

答案 1 :(得分:1)

您不能在序列中添加评论 IN 。但您可以在替代格式中添加注释,例如NCBI发布的基于XML的格式之一。