我在使用automake时遇到undefined reference
错误,只有在存储库中存在某个本地头文件(include/lmp2atomstyle.h
(同一存储库中的库所需)时才会出现此错误。 / p>
为了方便起见,我正在努力将多个automake项目源文件夹lmpio
和lmp2atomstyle
组合到一个文件夹中。这两个项目都是图书馆,它们也为测试提供了一个小程序。
手动合并Makefile.am
后,lmp2atomstyle
编译得很好,但lmpio
无法找到liblmp2atomstyle.so
中的符号:
$ make check
make lmpiotest
make[1]: Entering directory `/home/e.lorenz/code/lmputils'
/bin/sh ./libtool --tag=CXX --mode=link g++ -g -O2 -lfftw3 -llmpio -llmp2atomstyle -o lmpiotest src/lmpiotest.o -llammps_custom -lmpi_stubs
libtool: link: g++ -g -O2 -o .libs/lmpiotest src/lmpiotest.o -lfftw3 /home/e.lorenz/code/lmputils/.libs/liblmpio.so /cluster/gcc/gcc-4.8.2/lib/../lib64/libstdc++.so -lm /home/e.lorenz/code/lmputils/.libs/liblmp2atomstyle.so -llammps_custom -lmpi_stubs -Wl,-rpath -Wl,/usr/local/lib -Wl,-rpath -Wl,/cluster/gcc/gcc-4.8.2/lib/../lib64
/home/e.lorenz/code/lmputils/.libs/liblmpio.so: undefined reference to `lmp2atomstyle_parse_file(void*, char const*)'
/home/e.lorenz/code/lmputils/.libs/liblmpio.so: undefined reference to `lmp2atomstyle_get_style(void*, char*, unsigned long)'
/home/e.lorenz/code/lmputils/.libs/liblmpio.so: undefined reference to `lmp2atomstyle_create()'
collect2: error: ld returned 1 exit status
make[1]: *** [lmpiotest] Error 1
make[1]: Leaving directory `/home/e.lorenz/code/lmputils'
make: *** [check-am] Error 2
此处Makefile.am
:
AUTOMAKE_OPTIONS = subdir-objects
ACLOCAL_AMFLAGS = -I m4
AM_CPPFLAGS = -Iinclude
lib_LTLIBRARIES = liblmp2atomstyle.la liblmpio.la
include_HEADERS = include/lmpio.h include/lmp2atomstyle.h
liblmp2atomstyle_la_SOURCES = src/lmp2atomstyle.c
liblmp2atomstyle_la_LDFLAGS = -version-info 1:0:0
liblmpio_la_SOURCES = src/lmpio.cpp
liblmpio_la_LDFLAGS = -version-info 1:0:0 -llmp2atomstyle
bin_PROGRAMS = lmp2atomstyle
lmp2atomstyle_SOURCES = src/lmp2atomstyle_main.c
lmp2atomstyle_LDFLAGS = -llmp2atomstyle
check_PROGRAMS = lmpiotest
lmpiotest_SOURCES = src/lmpiotest.cpp
lmpiotest_LDADD = -llammps_custom -lmpi_stubs
lmpiotest_LDFLAGS = -lfftw3 -llmpio -llmp2atomstyle
首先,我假设了一个错误的链接顺序,但在仔细评估了所有库的依赖关系后,链接顺序似乎没问题。无论如何,它在存储库合并之前有效。我也只使用LDADD
,但它没有帮助。
跟踪更改后,我发现lmpio
只要include/lmp2atomstyle.h
不存在就编译正常,但会自动包含在/ usr / local / include中。此时尚未安装库。只要我将lmp2atomstyle.h
复制到include/
,就会发生错误。
我错过了什么?是否有关于本地标头和库的要求?使用automake时,头文件的路径如何导致链接错误?
后续问题:如果由于缺少外部警卫而导致,为什么在不同目录中编译时会有效?
以下是成功lmpiotest
投放的make check
输出,即没有include/lmp2atomstyle.h
:
make lmpiotest
make[1]: Entering directory `/home/e.lorenz/code/lmputils'
depbase=`echo src/lmpiotest.o | sed 's|[^/]*$|.deps/&|;s|\.o$||'`;\
g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -Iinclude -g -O2 -MT src/lmpiotest.o -MD -MP -MF $depbase.Tpo -c -o src/lmpiotest.o src/lmpiotest.cpp &&\
mv -f $depbase.Tpo $depbase.Po
/bin/sh ./libtool --tag=CXX --mode=link g++ -g -O2 -lfftw3 -llmpio -llmp2atomstyle -o lmpiotest src/lmpiotest.o -llammps_custom -lmpi_stubs
libtool: link: g++ -g -O2 -o .libs/lmpiotest src/lmpiotest.o -lfftw3 /home/e.lorenz/code/lmputils/.libs/liblmpio.so /cluster/gcc/gcc-4.8.2/lib/../lib64/libstdc++.so -lm /home/e.lorenz/code/lmputils/.libs/liblmp2atomstyle.so -llammps_custom -lmpi_stubs -Wl,-rpath -Wl,/usr/local/lib -Wl,-rpath -Wl,/cluster/gcc/gcc-4.8.2/lib/../lib64
make[1]: Leaving directory `/home/e.lorenz/code/lmputils'
我的configure.ac
:
AC_INIT([lmputils], [1.0], [(email...)])
LT_INIT
AM_INIT_AUTOMAKE()
AC_CONFIG_HEADERS([config.h])
AC_PROG_CXX
AM_PROG_CC_C_O
AC_CONFIG_FILES([Makefile])
AC_OUTPUT
最后,这是导致错误的最小目录树:
./include
./include/lmpio.h
./include/lmp2atomstyle.h
./src
./src/lmp2atomstyle.c
./src/lmp2atomstyle_main.c
./src/lmpio.cpp
./src/lmpiotest.cpp
./Makefile.am
./configure.ac
./autogen.sh
谢谢:)
答案 0 :(得分:2)
Matt McNabb指出,这与外部警卫有关:
在include/lmp2atomstyle.h
中,我忘了为c ++添加一个外部守卫:
#ifdef __cplusplus
extern "C" {
#endif
[function headers]
#ifdef __cplusplus
}
#endif
为我修好了。
后续问题: 在不同的目录中编译时为什么会这样?