用于Mac的原生GitHub应用程序将所有内容标记为已更改

Question

我在使用原生GitHub App for Mac时遇到了一些麻烦。

我正在使用Xcode和ObjectiveC实现iOS游戏。在对代码文件进行一些较小的更改后，GitHub应用程序会将文件中的所有内容标记为已更改：

如果我在Xcode中使用集成的源代码控制，一切正常：

我做错了什么？

感谢您的帮助。