R中是否有一种方法可以根据某列中的匹配值组合两个表？

Question

假设我有两个数据帧，df1和df2：

chrom   pos   genSym   type
1       4     blah     DEL
2       5     guh      INS   
1       6     poo      DEL
2       7     foo      MMP

chrom   pos   genSym   type
1       4     blah     DEL
3       3     grub     INS   
1       6     poo      INS
2       7     foo      MMP

我想以这样的方式组合它们，即包含相同chrom，pos和genSym值的行在同一行上配对（根据需要重复）。如果有任何意义，那么包含未在其他数据框中找到的chrom，pos和genSym值的行将被列为未配对。理想情况下，输出看起来像这样：

chrom   pos   genSym   type    chrom   pos   genSym   type 
1       4     blah     DEL     1       4     blah     DEL
2       5     guh      INS     
1       6     poo      DEL     1       6     poo      INS
2       7     foo      MMP     2       7     foo      MMP
                               3       3     grub     INS

R 中的包是否简化了这一点？如果 R 不能轻易做到这一点，是否有人有其他工具的建议？

Answer 1

获得你想要的东西

merge(df1, df2, by = c("chrom", "pos", "genSym"), all = T)

我也只是作为一种学习经历，试试这个

merge(df, df.other,by=x,all=T)

这是一个很好的参考https://stackoverflow.com/a/1300618/2747709，用于理解外部，左连接，右连接等，并查看sql样式匹配的其他答案。