将图形对象添加到AxesSubplot Gridspec

Question

我使用Biopython的Phylo模块生成树，并进一步使用gcf将当前树保存为matplotlib的图形对象。

tree = Phylo.read("my tree.nwk", "newick")  
Phylo.draw(tree)
tree_f=plt.gcf()

我希望能够在子图中使用这个图形对象：

gs = gridspec.GridSpec(1, 2, height_ratios=[1, 1, -2, 2],
                             width_ratios=[1, 1, -2, 2], hspace=0, wspace=0) 
phyl_ax = plt.subplot(gs[0])
ht_ax = plt.subplot(gs[1])

如何让phyl_ax占用一个数字对象？

我尝试了phyl_ax(tree_f)，但这失败了：

  

TypeError：＆＃39; AxesSubplot＆＃39;对象不可调用。

Answer 1

我还没有使用过Phylo，但是从documentation来看，你只需将轴设置为关键字：

phyl_ax=plt.subplot(gs[0])   
Phylo.draw(tree, axes=phyl_ax)