Question

这是我使用R的第一次使用XML的经历。所以，如果不是愚蠢的话，我的问题可能听起来很幼稚...... 我以

的模式下载了一个XML文件

<experiment>
  <sampleattribute>
    <category>AGE</category>
    <value>8</value>
    <value>10</value>
    <value>11</value>
  </sampleattribute>
  <sampleattribute>
    <category>SEX</category>
    <value>female</value>
    <value>male</value>
  </sampleattribute>
</experiment>
<experiment>
  <sampleattribute>
    <category>DESIGN</category>
    <value>control</value>
    <value>disease</value>
  </sampleattribute>
</experiment>
<experiment>
  <sampleattribute>
    <category>AGE</category>
    <value>8</value>
    <value>10</value>
    <value>11</value>
  </sampleattribute>
  <sampleattribute>
    <category>SEX</category>
    <value>female</value>
  </sampleattribute>
  <sampleattribute>
    <category>DESIGN</category>
    <value>control</value>
    <value>disease</value>
  </sampleattribute>
</experiment>

如您所见，每个节点都有不同。我希望以最终将它转换为数据帧的方式连接每个中的所有sampleattribute。

我已经尝试了attr＆lt; - xpathSApply（myxml，＆＃34; // experiment / sampleattribute＆＃34;），但无法追踪哪个样本有哪些。

非常感谢任何建议。

Answer 1

您无法获得具有此类XML的dataframe，而是列表。

使用XML包可以执行此操作，例如：

doc = htmlParse(txt,asText=TRUE)

res = lapply(xpathSApply(doc,'//experiment'),
       function(x){
         category = xpathSApply(x,'sampleattribute/category',xmlValue)
         values = xpathSApply(x,'sampleattribute/value',xmlValue)
         list(category=category,
              values =values)
       })

然后你可以检查你的结果：

 str(res)
 List of 3
 $ :List of 2
  ..$ category: chr [1:2] "AGE" "SEX"
  ..$ values  : chr [1:5] "8" "10" "11" "female" ...
 $ :List of 2
  ..$ category: chr "DESIGN"
  ..$ values  : chr [1:2] "control" "disease"
 $ :List of 2
  ..$ category: chr [1:3] "AGE" "SEX" "DESIGN"
  ..$ values  : chr [1:6] "8" "10" "11" "female" ..

如何将XML中具有相同名称的多个节点转换为R中的df / list？

1 个答案: