为什么tapply中的参数FUN与colwise结合无效

时间:2014-04-05 07:38:28

标签: r plyr tapply

我通常使用colwisetapply的组合来计算数据框中的分组值。但是,我意外地发现FUN中的参数tapply无法与colwise中的plyr一起正常工作。示例如下:

数据:

df <- data.frame(a = 1:10, b = rep(1:2, each = 5), c = 2:11)

正常:

library(plyr)
colwise(tapply)(subset(df, select = c(a, c)), df$b, function(x){sum(x[x > 2])})

以上代码是正确的,可以正常工作。但如果我添加FUN,那就错了:

colwise(tapply)(subset(df, select = c(a, c)), df$b, FUN = function(x){sum(x[x > 2])})

错误是:

Error in FUN(X[[1L]], ...) : 

unused arguments (function (X, INDEX, FUN = NULL, ..., simplify = TRUE) 
{
    FUN <- if (!is.null(FUN)) match.fun(FUN)
    if (!is.list(INDEX)) INDEX <- list(INDEX)
    nI <- length(INDEX)
    if (!nI) stop("'INDEX' is of length zero")
    namelist <- vector("list", nI)
    names(namelist) <- names(INDEX)
    extent <- integer(nI)
    nx <- length(X)
    one <- 1
    group <- rep.int(one, nx)
    ngroup <- one
    for (i in seq_along(INDEX)) {
        index <- as.factor(INDEX[[i]])
        if (length(index) != nx) stop("arguments must have same length")
        namelist[[i]] <- levels(index)
        extent[i] <- nlevels(index)
        group <- group + ngroup * (as.integer(index) - one)
        ngroup <- ngroup * nlevels(index)
    }
    if (is.null(FUN)) return(group)
    ans <- lapply(X = split(X, group), FUN = FUN, ...)
    index <- as.integer(names(ans))
    if (simplify && all(unlist(lapply(ans, length)) == 1)) {
        ansmat <- array(dim = extent, dimnames = namelist)

有人可以解释原因吗?提前谢谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

嗯,问题是lapplytapply都有一个可选的FUN参数。请注意,colwise(tapply)是一个包含以下行的函数:

out <- do.call("lapply", c(list(filtered, .fun, ...), dots))

让我们通过编写

来使用我们的调试器
ct <- colwise(tapply); trace(ct, quote(browser()), at = 6)

然后运行

ct(subset(df, select = c(a, c)), df$b, FUN = function(x){sum(x[x > 2])})

现在让我们打印c(list(filtered, .fun, ...), dots)。请注意,前三个(未命名)参数现在是数据框tapplydb$b,上面的FUN参数最后出现。但是,此参数是命名为。由于这是do.call上的lapply,而不是该参数成为tapply的可选参数,它现在成为lapply的主要调用!所以发生的事情就是你要把它变成:

lapply(subset(df, select = c(a, c)), function(x){sum(x[x > 2])}, tapply, df$b)

当然,这没有任何意义,如果您手动执行上述(仍在调试器中),您将得到完全相同的错误。有关简单的解决方法,请尝试:

tapply2 <- function(.FUN, ...) tapply(FUN = .FUN, ...)
colwise(tapply2)(subset(df, select = c(a, c)), df$b, .FUN = function(x){sum(x[x > 2])})

plyr包应检查名为...的{​​{1}}个参数(或任何可能干扰FUN工作的内容),但它似乎不是作者包括这个。您可以向执行以下任何变通办法的lapply包提交拉取请求:

定义本地

plyr

(进一步减少干扰)。

检查.lapply <- function(`*X*`, `*FUN*`, ...) lapply(X = `*X*`, `*FUN*`, ...) 函数中的names(list(...)) colwise(tapply)X(如果作者打算在子调用之前阻止对promises进行评估,则可能会出现问题)。

使用已命名的FUNdo.call("lapply", ...)明确调用X,以便获得预期的

FUN