使用CUDA在python中展开一个简单的可并行化for循环

时间:2014-04-04 05:25:46

标签: python opengl numpy cuda pycuda

我在python中有一个for循环,我要展开到GPU上。我想必须有一个简单的解决方案,但我还没有找到一个。

我们的函数循环遍历numpy数组中的元素,并将结果存储在另一个numpy数组中。每次迭代都会向此结果数组添加一些内容。我们的代码可能大的简化可能如下所示:

import numpy as np

a = np.arange(100)
out = np.array([0, 0])
for x in xrange(a.shape[0]):
  out[0] += a[x]
  out[1] += a[x]/2.0

如何在Python中展开这样的循环以在GPU上运行?

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

开始的地方是http://documen.tician.de/pycuda/例子

import pycuda.autoinit
import pycuda.driver as drv
import numpy

from pycuda.compiler import SourceModule
mod = SourceModule("""
__global__ void multiply_them(float *dest, float *a, float *b)
{
  const int i = threadIdx.x;
  dest[i] = a[i] * b[i];
}
""")

multiply_them = mod.get_function("multiply_them")

a = numpy.random.randn(400).astype(numpy.float32)
b = numpy.random.randn(400).astype(numpy.float32)

dest = numpy.zeros_like(a)
multiply_them(
        drv.Out(dest), drv.In(a), drv.In(b),
        block=(400,1,1), grid=(1,1))

print dest-a*b

将要并行化的代码部分放在C代码段中,并从python中调用它。

对于您的示例,您的数据大小需要远大于100才能使其值得。您需要某种方法将数据划分为块。如果你想添加1,000,000个数字,你可以将它分成1000个块。在并行代码中添加每个块。然后在python中添加结果。

对于这种类型的并行化,添加内容并不是一项自然的任务。 GPU倾向于为每个像素执行相同的任务。您有一项需要对多个像素进行操作的任务。

首先与cuda合作可能会更好。一个相关的线程是。 Understanding CUDA grid dimensions, block dimensions and threads organization (simple explanation)