Question

我写了这段代码。

目标如下：

对于临时列表中的每个文件，它应该首先出现列表，将其放入名为$name1的变量中，然后将列表的第二次出现到名为$name2的第二个变量中。变量是文件名。使用2个变量，我做了一个连接。

for files in $(cat temp.lst); do
 if [ $(cat temp.lst | wc -l) == 1 ]
  then 
   name=$(head -1 temp.lst)
   join -t\; -j 1 file_minus1.txt "$name" | sed 's/;;/;/g' > file1.txt
  else
   name1=$(head -1 temp.lst)
   name2=$(head -2 temp.lst)
   echo "var1 "$name1 "var2 "$name2
   sed '1,2d' temp.lst > tmpfile.txt
   mv tmpfile.txt temp.lst
   join -t\; -j 1 "$name1" "$name2" | sed 's/;;/;/g' > file_minus1.txt
  fi
;done

从理论上讲，它应该可行，但在这里它不起作用，唉。

我在代码中输入的echo行给了我3个变量而不是2个

var1 ei_etea17_m.tsv var2 ei_etea17_m.tsv ei_eteu25_m.tsv

更糟糕的是，加入并没有按照我想象的方式运行，而是给我这个错误代码

join: ei_etea17_m.tsv
ei_eteu25_m.tsv: No such file or directory

请查看我的temp.lst

的示例

ei_eteu27_m.tsv
ei_eteu28_m.tsv
ei_isbr_m.tsv
ei_isbu_m.tsv
ei_isin_m.tsv

欢迎任何建议。

最佳。

Answer 1

要在循环中提取文件的2行，请尝试以下操作：

paste - - < temp.lst | 
while read name1 name2; do
    if [[ -z $name2 ]]; then
        name2=$name1
        name1=file_minus1.txt
        output=file1.txt
    else
        output=file_minus1.txt
    fi
    join -t\; "$name1" "$name2" | sed 's/;;/;/g' > $output
done

注释

paste命令从文件中取出2行，并将它们连接成一行（由制表符分隔）
- 演示：seq 7 | paste - -
read可以分配给多个变量：该行将在空格上拆分（默认）并分配给命名变量。
在循环体中，我基本上遵循你的逻辑

Answer 2

要执行n - 方式连接，请使用递归:)

recursive_join () {
    # Zero files: do nothing (special case)
    # One file: output it
    # Multiple files: join the first with the result of joining the rest
    file1=$1
    shift || return
    [ "$#" -eq 0 ] && cat "$file1" ||
      recursive_join "$@" | join -t\; -j1 "$file1" -
 }

 recursive_join ei_eteu27_m.tsv ei_eteu28_m.tsv ei_isbr_m.tsv ei_isbu_m.tsv ei_isin_m.tsv

对此进行调整以使用列出输入文件的文件，而不是使用命令行参数，这是一个小问题。只要没有输入文件名包含空格或其他特殊字符，您只需使用

即可

recursive_join $(cat temp.lst)

或者，如果您想利用bash功能，可以使用数组：

while read; do files+=("$REPLY"); done < temp.lst
recursive_join "${files[@]}"

或bash 4：

readarray files < temp.list
recursive_join "${files[@]}"

但是，如果您只想坚持使用标准shell脚本，最好修改递归函数以从标准输入读取输入文件名。这使得函数变得更加丑陋，因为为了检测标准输入上是否只剩下一个文件，我们必须尝试读取第二个文件，如果成功则将其放回标准输入。

recursive_join () {
    IFS= read -r file1 || return
    IFS= read -r file2 &&
       { echo "$file2"; cat; } | recursive_join  | join -t\; -j1 "$file1" - ||
       cat "$file1"
}

recursive_join < temp.lst

创建一个可以使用命令行参数或从标准输入读取列表的函数留给读者练习。

Answer 3

变量name1获得第一行。变量name2获得前两行。如果你想让name2只有第二行你可以试试像：

name2=$(sed -n '2p')

同样sed -i将不再需要tmpfile.txt。

Answer 4

Ok Gents或Ladies。

我发现了为什么。

head -1 temp.lst仅提供没有扩展名的文件名。

我需要找到一种方法来包含扩展名。可行的。

bash问题：2个变量而不是1个

4 个答案: