Question

我对R，Shiny，Shiny Server和Ubuntu 12.04相当新。经过漫长的一天，我得到了一切正常工作，除了实际上有闪亮的服务器主机我的应用程序。我试图在本地托管我的应用。

这是我的错误：

Error in library(ggplot2) : there is no package called ‘ggplot2’ Calls: runApp ...
startAppDir -> sys.source -> eval -> eval -> library 
Execution halted

以下是＆gt; sessionInfo（）生成的一些相关信息：

R version 3.0.3 (2014-03-06)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] grid      stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods  
[8] base     

other attached packages:
[1] gridExtra_0.9.1 shiny_0.9.1     ggplot2_0.9.3.1

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] bitops_1.0-6       caTools_1.16       colorspace_1.2-4   dichromat_2.0-0   
 [5] digest_0.6.4       gtable_0.1.2       httpuv_1.2.3       labeling_0.2      
 [9] MASS_7.3-30        munsell_0.4.2      plyr_1.8.1         proto_0.3-10      
[13] RColorBrewer_1.0-5 Rcpp_0.11.1        reshape2_1.2.2     RJSONIO_1.0-3     
[17] scales_0.2.3       stringr_0.6.2      tcltk_3.0.3        tools_3.0.3       
[21] xtable_1.7-3      
>

我在没有闪亮服务器的情况下进行了测试，该应用程序正常运行

runApp("/var/shiny-server/www/examples/MY_APP/")

我还测试了发光服务器附带的示例，它们工作正常，但他们不使用ggplot2。

ggplot2已经明确安装，所以我怀疑这是一个许可问题（？）但是我不知道如何修复它......

感谢您的帮助！

*的解 * 使用.libPaths（）我能够确定由

安装的自定义包

>install.packages("ggplot2")

放在主目录

中

/home/USER/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/ggplot2

我不得不复制文件夹中的每个文件＆＃39; ~3.0 /＆＃39;进入

/usr/local/lib/R/site-library

现在有效！谢谢：D

Answer 1

尝试通过运行

将ggplot2软件包安装到系统目录（不是本地用户目录）

sudo R
(within R session)
install.packages('ggplot2')

由于shiny可能在不同的用户名下运行，因此它可能无法访问您本地安装的R库。

Answer 2

尝试：

install.packages("ggplot2", lib=.Library, dependencies=T)

问题是默认安装目录是.libPaths()中的第一个目录，它将是闪亮用户不共享的主目录站点。

R - Ubuntu上的闪亮服务器

2 个答案: