使用cusparse,我首先尝试使用以下大小的稀疏密集乘法:
C1 [8692 x 8692] = A1 [8692 x 7000 sparse] x B1 [7000 x 8692]
只需0.3秒。然后我做了另一个有以下尺寸的人:
C2 [8820 x 8820] = A2 [8820 x 32000 sparse] x B2 [32000 x 8820]
所需的时间取决于稀疏矩阵中的内容,但其范围为30秒到90秒。有什么办法可以加速吗?如果可以减少运行时间,我可以用不同的方式来切割矩阵,但我不确定这里的性能问题是什么。
稀疏矩阵A1和A2以CSR格式存储,并且它们具有较差的稀疏模式,但它们同样糟糕。下面的两个数字分别显示了非零元素在A1和A2中的位置。两种情况下每列的非零元素被控制为固定为127.
答案 0 :(得分:3)
从矩阵的稀疏模式中,您应该将矩阵A1分成2部分,其中矩阵A11包含大约前8000行,A12则包含剩余行,并使用csrmv两次。这样,cusparse将为每行的线程数选择更好的启发式算法。
您还应该考虑使用CUSPARSE 6.0 csrmv2中的新版本和转置大小写。您需要首先转置B(使用cublasgeam)并执行:
C = A1 *(B')'
转置案例要好得多,因为对B的访问都是合并的。
另一种选择是密集A1(使用cusparsecsr2dense)并使用cublas