通过计算集群加载python模块

Question

我有一个使用Scientific Linux的计算群集的帐户。当然我只有用户访问权限。我正在使用python，我需要运行python脚本，所以我需要导入一些python模块。由于我没有root访问权限，因此我在$ HOME上安装了一个包含所有必需模块的本地python副本。当我在我的帐户（托管节点）上运行脚本时，它们正确运行。但是为了将作业提交到计算队列（在更快的机器上处理），我需要提交一个bash脚本，该脚本具有执行脚本的行。计算群集使用SunGrid Engine。但是，当我提交bash脚本时，出现错误，我找不到我安装的模块！

所以我对这个问题的理解是没有发送模块或者执行脚本的机器。我的问题是：是否可以在脚本中包含所有模块？

编辑：我刚创建了一个运行which python的bash脚本，我注意到输出不是我的python副本。但是当我在我的ssh帐户上运行'which python'时，我正确地得到了我的python副本..

Answer 1

提交的脚本很可能是使用系统Python安装而不是您自己的。尝试仅使用一个命令which python提交shell脚本进行确认。

修复方法是将Python解释器的路径添加到系统路径中。在我的机器上，正确的Python安装在/Users/mbatchkarov/anaconda/bin/python。我将export PATH="/Users/mbatchkarov/anaconda/bin:$PATH"添加到~/.bash_profile

编辑将同一行添加到~/.bashrc。