我有实验数据表示为每个实验的键值对的序列。一组相关实验被序列化为JSON中这些dicts的列表。这可以通过rjson
包在R中解析,但是数据以一种难以分析的形式加载
data <- fromJSON('[{"k1":"v1","k2":"v2"}, {"k1":"v3","k2":"v4"}]')
产量
[[1]]
[[1]]$k1
[1] "v1"
[[1]]$k2
[1] "v2"
[[2]]
[[2]]$k1
[1] "v3"
[[2]]$k2
[1] "v4"
尝试直接将data.frame
转换为as.data.frame(data)
会产生:
k1 k2 k1.1 k2.1
1 v1 v2 v3 v4
清楚地将所有实验中的键/值对序列视为平坦的一维列表。
我想要的是一个更传统的表格,每个实验都有一行,每个唯一键一列:
k1 k2
1 v1 v2
2 v3 v4
如何在R?
中干净地表达这种转换答案 0 :(得分:11)
在进行列表处理时,l*ply
函数可能是您最好的朋友。试试这个:
> library(plyr)
> ldply(data, data.frame)
k1 k2
1 v1 v2
2 v3 v4
plyr
在幕后进行一些非常好的处理来处理不规则列表之类的事情(例如,当每个列表不包含相同数量的元素时)。这在JSON和XML中很常见,并且处理基本函数很棘手。
或者使用基本功能:
> do.call("rbind", lapply(data, data.frame))
如果你有不规则的列表,你可以使用rbind.fill
(来自plyr
)代替rbind
,但我建议你从一开始就使用plyr
来制作你的> x<-list(list(k1=2,k2=3),list(k2=100,k1=200),list(k1=5, k3=9))
> ldply(x, data.frame)
k1 k2 k3
1 2 3 NA
2 200 100 NA
3 5 NA 9
生活更轻松。
编辑:
关于你更复杂的例子,使用Hadley的建议很容易解决这个问题:
{{1}}
答案 1 :(得分:4)
这很有趣。最简单的方法是修复Python代码,以便更容易转换dict。
但是,这个怎么样?
k1 <- unlist(lapply(data,FUN=function(x){return(x[[1]])}))
k2 <- unlist(lapply(data,FUN=function(x){return(x[[2]])}))
data.frame(k1,k2)
您仍然需要将k1和k2转换为正确的数据类型,但这应该可以实现您所需的目标。