致命错误:RcppEigen.h:没有这样的文件或目录

时间:2014-03-23 20:04:28

标签: r rcpp

我对RcppRcppEigen很新,可能这就是为什么我不能自己搞清楚:

我只想写一个包含Eigen库的c ++函数。为了测试它是否有效我从http://people.math.aau.dk/~sorenh/misc/Rdocs/Rcpp/RcppSHLIB.pdf获取了以下示例:

#include <Rcpp.h>
#include <RcppEigen.h>
RcppExport SEXP C_spdinv_eigen ( SEXP X_ ){
using Eigen::Map;
using Eigen::MatrixXd;
typedef Eigen::Map<Eigen::MatrixXd> MapMatd;
const MapMatd X(Rcpp::as<MapMatd>(X_));
const MatrixXd Xinv(X.inverse());
return(Rcpp::wrap(Xinv));
}

但我收到以下错误:

rcpp-test.cpp:2:23: fatal error: RcppEigen.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [rcpp-test.o] Error 1
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG    -I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include"    -fpic  -O3 -pipe  -g  -c rcpp-test.cpp -o rcpp-test.o 
Error in Rcpp::sourceCpp("rcpp-test.cpp") : 
  Error 1 occurred building shared library.

编译只有#include <Rcpp.h>的脚本才能正常运行。 RcppEigen.h - 位于/usr/local/lib/R/site-library/RcppEigen/include目录中的文件。我尝试使用RcppEigenR CMD INSTALL ...安装install.package:既没有效果。

我的seccionInfo是

R version 3.0.2 (2013-09-25)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C         LC_TIME=C            LC_COLLATE=C         LC_MONETARY=C       
 [6] LC_MESSAGES=C        LC_PAPER=C           LC_NAME=C            LC_ADDRESS=C         LC_TELEPHONE=C      
[11] LC_MEASUREMENT=C     LC_IDENTIFICATION=C 

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] RcppEigen_0.3.2.1.1 Rcpp_0.11.1        

loaded via a namespace (and not attached):
[1] Matrix_1.1-1.1  grid_3.0.2      lattice_0.20-27 tools_3.0.2    

感谢您的帮助!

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

您没有说 您试图编译您的函数。重要的是:

  • 在包中,使用LinkingTo: RcppEigen

  • 在与Rcpp属性一起使用的函数中,使用正确的Rcpp::depends(RcppEigen)

这里有很多例子,在Rcpp Gallery和其他地方。关注他们,但请遵循所有步骤。现在你有编译器告诉你RcppEigen未知。

我的Rcpp book详细信息会在第2章中构建问题。