numpy数组中的索引,其中另一个数组中的切片

时间:2014-03-22 21:37:39

标签: python arrays numpy python-3.3

实际问题出现在某些机器学习应用程序中,数据有点复杂。所以这是一个能够捕捉问题本质的MWE:

我有两个阵列如下:

L = np.arange(12).reshape(4,3)
M = np.arange(12).reshape(6,2)

现在,我想找到L中的行R,这样M中存在一些由R中除了最后一个元素之外的所有元素组成的行。

从上面的示例代码中,LM如下所示:

array([[ 0,  1,  2],  # L
       [ 3,  4,  5],
       [ 6,  7,  8],
       [ 9, 10, 11]])

array([[ 0,  1],  # M
       [ 2,  3],
       [ 4,  5],
       [ 6,  7],
       [ 8,  9],
       [10, 11]])

我想从这些L中标记的行,作为一个numpy数组:

array([[ 0,  1,  2],
       [ 6,  7,  8]])

如果我将LM表示为python列表,我会这样做:

L = [[0, 1, 2], [3, 4, 5], [6, 7, 8], [9, 10, 11]]
M = [[0, 1], [2, 3], [4, 5], [6, 7], [8, 9], [10, 11]]
answer = [R for R in L if R[:-1] in M]

现在,我知道我可以在numpy中使用类似的列表理解并将结果转换为数组,numpy就像它一样棒,可能有更优雅的方式来做我不知道的事情。

我试着调查np.where(以获得所需的索引,然后我可以将L替换为L),但这似乎不能满足我的需要。

我很感激任何帮助

4 个答案:

答案 0 :(得分:4)

好的,我想我明白了。诀窍是向M添加另一个维度,然后您可以使用广播:

M.shape += (1,)
E = np.all(L[:,:-1].T == M, 1)

你得到一个6x4布尔矩阵E,它给你比较L的所有行和M的所有行的结果。

从这里很容易完成:

result = L[np.any(E,0)]

通过这种方式,解决方案得以简化,您不需要任何lambda函数或"隐式循环" (例如np.apply_along_axis())。

是的,numpy矢量化很漂亮(但有时你必须认为很抽象)......

答案 1 :(得分:3)

与Bitwise的答案非常相似:

def fn(a):
    return lambda b: np.all(a==b, axis=1)
matches = np.apply_along_axis(fn(M), 1, L[:,:2])
result = L[np.any(matches, axis=1)]

引擎盖下发生的事情是这样的(我将使用Bitwise的例子,这更容易证明):

>>> M
array([[ 0,  1],
       [ 2,  3],
       [ 4,  5],
       [ 6,  7],
       [ 8,  9],
       [10, 11]])
>>> M.shape+=(1,)
>>> M
array([[[ 0],
        [ 1]],

       [[ 2],
        [ 3]],

       [[ 4],
        [ 5]],

       [[ 6],
        [ 7]],

       [[ 8],
        [ 9]],

       [[10],
        [11]]])

这里我们为M数组添加了另一个维度,现在是(6,2,1)。

>>> L2 = L[:,:-1].T

然后我们摆脱2的最后一列,并转置数组,使维度为(2,4)

这就是魔术,M和L2现在可以播放到维度阵列(6,2,4)。

正如numpy的医生所说:

  

如果一组数组被称为“可广播”到相同的形状   上述规则产生有效结果,即下列之一   真:

The arrays all have exactly the same shape.
The arrays all have the same number of dimensions and the length of each dimensions is either a common length or 1.
The arrays that have too few dimensions can have their shapes prepended with a dimension of length 1 to satisfy property 2.
     

实施例

     

如果a.shape是(5,1),b.shape是(1,6),c.shape是(6,),d.shape是   ()所以d是标量,然后a,b,c和d都可以播放到   尺寸(5,6);和

a acts like a (5,6) array where a[:,0] is broadcast to the other columns,
b acts like a (5,6) array where b[0,:] is broadcast to the other rows,
c acts like a (1,6) array and therefore like a (5,6) array where c[:] is broadcast to every row, and finally,
d acts like a (5,6) array where the single value is repeated.

M [:,:0]将重复4次以填充3 dim,L2将被添加到新的维度并重复6次以填充它。

>>> B = np.broadcast_arrays(L2,M)
>>> B
[array([[[ 0,  3,  6,  9],
        [ 1,  4,  7, 10]],

       [[ 0,  3,  6,  9],
        [ 1,  4,  7, 10]],

       [[ 0,  3,  6,  9],
        [ 1,  4,  7, 10]],

       [[ 0,  3,  6,  9],
        [ 1,  4,  7, 10]],

       [[ 0,  3,  6,  9],
        [ 1,  4,  7, 10]],

       [[ 0,  3,  6,  9],
        [ 1,  4,  7, 10]]]),


array([[[ 0,  0,  0,  0],
        [ 1,  1,  1,  1]],

       [[ 2,  2,  2,  2],
        [ 3,  3,  3,  3]],

       [[ 4,  4,  4,  4],
        [ 5,  5,  5,  5]],

       [[ 6,  6,  6,  6],
        [ 7,  7,  7,  7]],

       [[ 8,  8,  8,  8],
        [ 9,  9,  9,  9]],

       [[10, 10, 10, 10],
        [11, 11, 11, 11]]])]

我们现在可以按元素进行比较:

>>> np.equal(*B)
array([[[ True, False, False, False],
        [ True, False, False, False]],

       [[False, False, False, False],
        [False, False, False, False]],

       [[False, False, False, False],
        [False, False, False, False]],

       [[False, False,  True, False],
        [False, False,  True, False]],

       [[False, False, False, False],
        [False, False, False, False]],

       [[False, False, False, False],
        [False, False, False, False]]], dtype=bool)

行到行(轴= 1):

>>> np.all(np.equal(*B), axis=1)
array([[ True, False, False, False],
       [False, False, False, False],
       [False, False, False, False],
       [False, False,  True, False],
       [False, False, False, False],
       [False, False, False, False]], dtype=bool)

聚合L's:

>>> C = np.any(np.all(np.equal(*B), axis=1), axis=0)
>>> C
array([ True, False,  True, False], dtype=bool)

这为你提供了应用于L的布尔掩码。

>>> L[C]
array([[0, 1, 2],
       [6, 7, 8]])

apply_along_axis将利用相同的功能,但减少L's维度而不是增加M(因此添加隐式循环)。

答案 2 :(得分:0)

>>> import hashlib
>>> fn = lambda xs: hashlib.sha1(xs).hexdigest()
>>> m = np.apply_along_axis(fn, 1, M)
>>> l = np.apply_along_axis(fn, 1, L[:,:-1])
>>> L[np.in1d(l, m)]
array([[0, 1, 2],
       [6, 7, 8]])

答案 3 :(得分:0)

>>> print np.array([row for row in L if row[:-1] in M])
[[0 1 2]
 [6 7 8]]