HDF5从R中的组中的所有文件分组/提取相同的数据层

Question

我是一个相对较新的R用户。我在从几个HDF5文件中提取相同文件时遇到问题。这就是我使用rhdf5包所做的：

files <- list.files(pattern = ".he5",full.names=TRUE)

我无法从所有HDF5文件中提取的文件具有扩展名

"/HDFEOS/SWATHS/ColumnAmountNO2/Data Fields/ColumnAmountNO2Trop"

当我为单个文件运行以下命令时，它可以工作：

NO2he5<-h5read("MA.he5","/HDFEOS/SWATHS/ColumnAmountNO2/Data Fields/ColumnAmountNO2Trop")

如何将此转换为可以同时为多个hdf5文件提取图层的函数？

Answer 1

请参阅lapply：

library(rhdf5)
files <- list.files(pattern = ".he5", full.names = TRUE)
attribute <- "/HDFEOS/SWATHS/ColumnAmountNO2/Data Fields/ColumnAmountNO2Trop"
out.list <- lapply(files, h5read, attribute)

这会将所有读取的对象存储到一个对象中：列表。与创建文件一样多的对象是首选方法。