Question

我在向量中有数字数据，我正在尝试运行kmeans。以下是错误

> kmeans( mydata, centers = 2 ) # trying centers 2 to 20 but failing at 2
Error in do_one(nmeth) : NAs in foreign function call (arg 13)
In addition: Warning message:
In do_one(nmeth) : NAs introduced by coercion

> str(mydata)
 num [1:44990687] 3.44e-06 3.44e-06 3.44e-06 3.44e-06 4.35e-05 ...
> is.numeric(mydata)
[1] TRUE

我的代码适用于小于此数据集的数据集，所以我怀疑它可能与数据的大小有关。有关如何修复错误的任何想法？提前谢谢。

更新：我尝试了以下内容：

> x <- length(mydata)
> kmeans( mydata[1:(x/2)], centers = 2 )
> kmeans( mydata[(x/2):x], centers = 2 )

两次调用kmeans都没有错误。所以看起来它确实与数据的大小有关，而与格式/类型无关。如果是这样的话，我该怎么做才能处理它？再次感谢。

Answer 1

尝试使用以前版本的R，例如2.15.3。这对我有用。

在撰写本文时，我遇到了类似的问题，v3.1.2并重新创建了NA强制问题。

我在这里创建了一个类似的线程： kmeans on 46 million elements coerces NA values

Answer 2

当我修复另一个错误时，这是由我（由我）引入到R 3.0.1中的错误。 http://bugs.r-project.org/bugzilla/show_bug.cgi?id=15364#c6 包含原始错误报告和GökcenEraslan关于此问题的报告。

该错误已于10分钟前在R 3.2.0 alpha中修复（大约两周后显示为R 3.2.0）。但请注意，您的nrow(x)已经在最大32位整数（2 ^ 31 - 1）的＆lt; = 50之内，这是默认{{1}的行数的严格上限R中的算法，因为它目前使用的标准Fortran不允许更大的矩阵尺寸。

Answer 3

我有同样的错误，当我读错误日志时，它说的是NaN，这意味着不是数字。所以我仔细检查我的数据集，是的，有一行包含一个字符串（单词）。我删除了那个字符串，它完美无缺。

R kmeans在外部函数调用（arg 13）错误中的NAs

3 个答案: