Question

运行一些命令后，我得到一个如下所示的文本文件：

TACTATATTACTGGAAAAACCATCAAGCTAGACCA
AATATGTCCCAGTTGAAGAGAATTATCATTTTGAG
AGAATTATCATTTTGAGATTGCTATCGTTCACCAA
AATATGTCCCAGTTGAAGAGAATTATCATTTTGAG
CTAGACCAATATAATATGTCCCAGTTGAAGAGAAT
AGATTGCTATCGTTCACCAAATACTGGCAAATAAT

此文本文件每次都会更改，我想在另一个包含数千行的文件中搜索所有这些字符串。请记住字符串不一样，它们每次都会更改，因此我不能只复制和粘贴它们，然后使用grep命令进行搜索。我尝试将grep命令与文件（grep -f test.txt all_lines.txt）一起使用，但它只搜索第一行。我有很多这样的文件，所以我需要一种非常有效的方法。我怎么能这样做？

Answer 1

您可以尝试使用以下awk单行。由于您尚未发布要检查的文件中的数据，因此可能需要修改答案以满足您的需求：

awk '
NR==FNR { lines[$0]++; next }
{ 
  for(line in lines) {
    if(index($0,line)>0) {
      print $0 " <===> " line
    }
  }
}' smallfile bigfile

这是一个小测试：

$ cat f1
ba
cat
bee

$ cat f2
caterpillar
balloon
beautiful

$ awk 'NR==FNR{a[$0]++;next}{for(x in a){if(index($0,x)>0){print $0" <===> "x}}}' f1 f2
caterpillar <===> cat
balloon <===> ba

您并不需要命令中的<===>。那只是为了演示。

Answer 2

很多时候我们被要求搜索字符串，但我们不知道它可能潜伏在哪里。

# find . -type f -exec grep "string or options" / dev/null {} \;

通常只使用：

 # find . -type f -exec grep "string or options" {} \;

生成目标字符串，但您不知道它的位置。请记住，当对多个文件进行grep'ing时，文件名将在匹配前列出。

$grep there *

foo: I found the target here
bar: You are there

在我们的find命令中，我们使用/dev/null作为要搜索的文件，因为我们知道如果在"{}";中找到字符串，搜索将始终失败，然后打印文件名。

同时搜索多个字符串

2 个答案: