Question

我正在进行模拟，并尝试重复向列添加错误，特别是标题为Ao的列。在我的输出中，前30行是正确的;我们有初始数据，第一年更改数据（错误添加到Ao），但之后，我希望有30年的添加错误，我会重复第2年的Ao到30年。我的目标是我每年抽样后添加错误。 IE浏览器。 2年级是1年级Ao +错误。 3年级是2年级Ao +错误，依此类推。有帮助吗？欢呼声。

    for(t in 1:30){
      Error<-rnorm(1000,0,1)
      m<-rep(year1data$m,30)
      r<-rep(year1data$r,30)
      a<-rep(year1data$a,30)
      g<-rep(year1data$g,30)
      Year<-rep(2:31, each=TotSpecies)
      Species<-1:TotSpecies
      Ao<-year1data$Ao+sample(Error,TotSpecies,replace=FALSE)
      TotSpeciesdata<-data.frame(Species,Year,Ao,m,r,a,g)
      TotSpeciesdata<-rbind(year1data,TotSpeciesdata)
    }

     > TotSpeciesdata
    Species Year         Ao   m          r         a         g
    1         1    1  25.770783  43 119.110786 3.2305180 2.6526471
    2         2    1  53.908914 138 161.894541 0.7342070 0.1151602
    3         3    1   2.010732 226 193.820489 2.2890904 3.6248105
    4         4    1  23.742254 332  17.315335 1.4009572 2.0037931
    5         5    1   4.291080  63 187.591209 0.2563995 2.1553908
    6         6    1   4.691113 343 116.267867 0.3899113 3.3950085
    7         7    1 604.133044 224 132.240197 3.0410743 0.7985524
    8         8    1  13.332567 166   5.367118 0.7921644 1.7861011
    9         9    1   3.759268 141 212.340970 2.8733737 2.7123141
    10       10    1   3.647390 209 259.400858 0.1249936 0.6594659
    11       11    1  23.731109  10 114.171147 2.2437372 0.9867591
    12       12    1  85.116996  69 167.412993 0.8306823 2.8905148
    13       13    1  31.684280 277 177.025460 2.7618332 2.9245554
    14       14    1  30.657523 205  21.710438 2.7661347 1.5911379
    15       15    1  12.240410  85 210.121109 2.8827455 3.0418454
    16        1    2  27.038097  43 119.110786 3.2305180 2.6526471
    17        2    2  54.251600 138 161.894541 0.7342070 0.1151602
    18        3    2   2.010636 226 193.820489 2.2890904 3.6248105
    19        4    2  22.699369 332  17.315335 1.4009572 2.0037931
    20        5    2   4.542589  63 187.591209 0.2563995 2.1553908
    21        6    2   3.607833 343 116.267867 0.3899113 3.3950085
    22        7    2 604.480756 224 132.240197 3.0410743 0.7985524
    23        8    2  13.663513 166   5.367118 0.7921644 1.7861011
    24        9    2   2.138715 141 212.340970 2.8733737 2.7123141
    25       10    2   3.642769 209 259.400858 0.1249936 0.6594659
    26       11    2  22.897993  10 114.171147 2.2437372 0.9867591
    27       12    2  85.490897  69 167.412993 0.8306823 2.8905148
    28       13    2  31.689202 277 177.025460 2.7618332 2.9245554
    29       14    2  30.644419 205  21.710438 2.7661347 1.5911379
    30       15    2  12.050207  85 210.121109 2.8827455 3.0418454
    31        1    3  27.038097  43 119.110786 3.2305180 2.6526471
    32        2    3  54.251600 138 161.894541 0.7342070 0.1151602
    33        3    3   2.010636 226 193.820489 2.2890904 3.6248105
    34        4    3  22.699369 332  17.315335 1.4009572 2.0037931
    35        5    3   4.542589  63 187.591209 0.2563995 2.1553908
    36        6    3   3.607833 343 116.267867 0.3899113 3.3950085
    37        7    3 604.480756 224 132.240197 3.0410743 0.7985524
    38        8    3  13.663513 166   5.367118 0.7921644 1.7861011
    39        9    3   2.138715 141 212.340970 2.8733737 2.7123141
    40       10    3   3.642769 209 259.400858 0.1249936 0.6594659
    41       11    3  22.897993  10 114.171147 2.2437372 0.9867591
    42       12    3  85.490897  69 167.412993 0.8306823 2.8905148
    43       13    3  31.689202 277 177.025460 2.7618332 2.9245554
    44       14    3  30.644419 205  21.710438 2.7661347 1.5911379
    45       15    3  12.050207  85 210.121109 2.8827455 3.0418454

Answer 1

您的方法遇到的主要问题是：

TotSpeciesdata<-data.frame(Species,Year,Ao,m,r,a,g)

因为Year是30 * TotSpecies向量，但所有其他向量只有TotSpecies长。因此，实际上，当您创建数据框时，您将回收除Year之外的所有列30次，这将导致第2年数据重复30次，等等。如果您只有Year <- rep(i + 1, TotSpecies)我认为您的逻辑将正常工作。也就是说，这是另一种方法：

对于每个物种，这将为该物种创建一个以Ao开始的递增随机游走5年（仅用于显示目的）：

set.seed(1)
year1data <- data.frame(species=1:10, year=1, Ao=runif(10, 1, 700))
TotSpeciesData <- do.call(
  rbind, 
  lapply(
    split(year1data, year1data$species),
    function(data) 
      with(
        data, 
        data.frame(species=species, year=year, Ao=c(Ao, Ao + cumsum(rnorm(5)))
) ) ) )
head(TotSpeciesData, 15)

注意我排除了m-g列，因为它们似乎与您的特定问题没有直接关系，但您可以相对轻松地添加它们。除了第1年，我也只做了5年，所以你可以在这里看到结果，但这也很容易改变：

    species year       Ao
1.1       1    1 186.5906
1.2       1    1 185.7701
1.3       1    1 186.2575
1.4       1    1 186.9958
1.5       1    1 187.5716
1.6       1    1 187.2662
2.1       2    1 261.1146
2.2       2    1 262.6264
2.3       2    1 263.0162
2.4       2    1 262.3950
2.5       2    1 260.1803
2.6       2    1 261.3052
3.1       3    1 401.4245
3.2       3    1 401.3796
3.3       3    1 401.3634

Answer 2

有人指出，您在上面提供的代码，或者至少是我编辑过的代码，每15年重复一次，而不是以逐步的方式呈现独特的年份。我编辑了它，如下所示：

TotSpeciesData <- do.call(
  rbind, #bind the table by rows
  lapply(    #applying the function in list form
    split(year1data, year1data$Species),   #splits data into groups by species
    function(data) 
      with(
        data, 
        data.frame(Species=Species, Year=1:Community, Ao=c(Ao, Ao + cumsum(rnorm((TotSpecies-1),0,2))),m=m, r=r, a=a, g=g) #data frame is Species, Year, 
        ) ) ) 
  TotSpeciesData$Ao[TotSpeciesData$Ao<0]<-0                 #any values less than 0 go to 0
TotSpeciesData<-TotSpeciesData[order(TotSpeciesData$Year),] #orders the data frame by Year

当我执行此代码时：

TotSpeciesData[TotSpeciesData$Species==1 & TotSpeciesData$Year %in% c(1,2,16,17),]

我最终输出的数据显示数据正在重复。

Species Year       Ao   m        r        a        g   
1.1        1    1 48.49161 239 332.9625 3.791778 2.723104
1.2        1    2 49.62851 239 332.9625 3.791778 2.723104
1.16       1   16 48.49161 239 332.9625 3.791778 2.723104
1.17       1   17 49.62851 239 332.9625 3.791778 2.723104

对此有何评论？

将rnorm添加到循环中的列中

2 个答案: