Question

我有一个数据结构，其中rownames是基因的名称（示例数据集位于底部）。但是，并非所有名称都是已知的。在这种情况下，rowname是X.，所以X.1，X.2，X.3等。我想计算我的数据集中有多少没有名称的基因，所以计算所有的X.值。

我如何计算类似的rownames？

structure(c(3.98955, 4.34032, 4.84637, 4.18783, 4.03547, 4.28602, 
3.85645, 4.26538, 4.67382, 4.15131, 4.03988, 4.35458, 3.91201, 
4.0837, 4.53863, 4.06491, 4.05978, 4.53879, 11.5801, 11.2286, 
11.2579, 10.5792, 9.98419, 10.6074, 11.7636, 10.9253, 10.9952, 
10.2337, 9.51475, 10.0747, 10.5695, 10.9376, 11.4955, 10.3862, 
10.0824, 9.1608), .Dim = c(6L, 6L), .Dimnames = list(c("X.9", 
"X34k", "lers", "afaf", "X.12", "X.3434"), c("Sham3.r1", 
"Sham3.r2", "Sham3.r3", "T00d4h.r2", "T00d4h.r3", "T00d4h.r4"
)))

Answer 1

您可以使用grep：

length(grep("X.", rownames(DF), fixed=TRUE))
#[1] 3

计算R中rownames相似的行

1 个答案: