我有一个包含24个子目录的目录,没有按时间顺序排列 我需要进入一个子目录,在那里解压缩文件然后在解压缩文件上调用“tophat”命令,然后移动到下一个子目录。循环应该通过这些命令遍历所有子目录。 我真的不知道如何创建这个循环(我需要它在显示器上运行而不是按照数字顺序运行)
(当然,许多使用RNA-seq结果的人都熟悉这个问题) 如果有人可以帮助我 我会非常感激
答案 0 :(得分:1)
for d in "/path/to/"*/
do
cd "$d" || continue
unzip the_file.zip
tophat the_file
done
答案 1 :(得分:0)
使用find
:
find /path -type d -print | \
while read path ; do
...
done
注意:当文件名包含换行符时,此循环会中断。
答案 2 :(得分:-1)
使用for循环
for directory in `find /path -type d -print`
do
cd "$directory"
unzip zip_filename
sh zip_dir/script_file.sh &
done