为什么`pickle.dump` +`pickle.load` IPC这么慢,有快速替代品吗?

时间:2014-02-25 00:54:34

标签: performance io ipc python-2.x

我正在使用python子进程进行IPC。现在,我们假设我必须使用subprocess.Popen来生成其他进程,因此我无法使用multiprocessing.Pipe进行通信。首先,我想到的是使用pickle.load + pickle.dump的STDIO流(现在不要担心安全性)。

然而,我注意到,传输速率只是可怕:我机器上的订单量为750KB / s!这比通过multiprocessing.Pipe进行通信的速度要慢95,根据我的理解,它也使用pickle。使用cPickle也没有任何好处。

更新:注意,我意识到,这只是python2上的情况!在python3上它运行正常。)

为什么这么慢?我怀疑原因是在.dump / .load中通过python文件对象而不是C文件描述符执行IO的方式。也许它与GIL有关?

是否有任何跨平台方式可以获得与multiprocessing.Pipe相同的速度?

我已经发现,在linux上可以使用_multiprocessing.Connection(或python3上的multiprocessing.connection.Connection来包装子进程的STDIO文件描述符并得到我想要的东西。但是,这在win32上是不可能的,我甚至不知道Mac。

基准:

from __future__ import print_function
from timeit import default_timer
from subprocess import Popen, PIPE
import pickle
import sys
import os
import numpy
try:
    from _multiprocessing import Connection as _Connection
except ImportError:
    from multiprocessing.connection import Connection as _Connection

def main(args):
    if args:
        worker(connect(args[0], sys.stdin, sys.stdout))
    else:
        benchmark()

def worker(conn):
    while True:
        try:
            amount = conn.recv()
        except EOFError:
            break
        else:
            conn.send(numpy.random.random(amount))
    conn.close()

def benchmark():
    for amount in numpy.arange(11)*10000:
        pickle = parent('pickle', amount, 1)
        pipe = parent('pipe', amount, 1)
        print(pickle[0]/1000, pickle[1], pipe[1])

def parent(channel, amount, repeat):
    start = default_timer()
    proc = Popen([sys.executable, '-u', __file__, channel],
                stdin=PIPE, stdout=PIPE)
    conn = connect(channel, proc.stdout, proc.stdin)
    for i in range(repeat):
        conn.send(amount)
        data = conn.recv()
    conn.close()
    end = default_timer()
    return data.nbytes, end - start

class PickleConnection(object):
    def __init__(self, recv, send):
        self._recv = recv
        self._send = send
    def recv(self):
        return pickle.load(self._recv)
    def send(self, data):
        pickle.dump(data, self._send)
    def close(self):
        self._recv.close()
        self._send.close()

class PipeConnection(object):
    def __init__(self, recv_fd, send_fd):
        self._recv = _Connection(recv_fd)
        self._send = _Connection(send_fd)
    def recv(self):
        return self._recv.recv()
    def send(self, data):
        self._send.send(data)
    def close(self):
        self._recv.close()
        self._send.close()

def connect(channel, recv, send):
    recv_fd = os.dup(recv.fileno())
    send_fd = os.dup(send.fileno())
    recv.close()
    send.close()
    if channel == 'pipe':
        return PipeConnection(recv_fd, send_fd)
    elif channel == 'pickle':
        return PickleConnection(os.fdopen(recv_fd, 'rb', 0),
                                os.fdopen(send_fd, 'wb', 0))
    else:
        raise ValueError("Invalid channel: %s" % channel)

if __name__ == '__main__':
    main(sys.argv[1:])

结果:

benchmark

非常感谢阅读,

托马斯

更新

好的,所以我按照@martineau的建议对其进行了分析。对于具有固定值amount=500000的单次运行,在独立调用中获得以下结果。

在父进程中,按 tottime 排序的热门调用是:

      11916 function calls (11825 primitive calls) in 5.382 seconds

Ordered by: internal time

ncalls  tottime  percall  cumtime  percall filename:lineno(function)
    35    4.471    0.128    4.471    0.128 {method 'readline' of 'file' objects}
    52    0.693    0.013    0.693    0.013 {method 'read' of 'file' objects}
     4    0.062    0.016    0.063    0.016 {method 'decode' of 'str' objects}

在子流程中:

      11978 function calls (11855 primitive calls) in 5.298 seconds

Ordered by: internal time

ncalls  tottime  percall  cumtime  percall filename:lineno(function)
    52    4.476    0.086    4.476    0.086 {method 'write' of 'file' objects}
    73    0.552    0.008    0.552    0.008 {repr}
     3    0.112    0.037    0.112    0.037 {method 'read' of 'file' objects}

这让我很担心,使用readline可能是表现不佳的原因。

以下连接仅使用pickle.dumps / pickle.loadswrite / read

class DumpsConnection(object):
    def __init__(self, recv, send):
        self._recv = recv
        self._send = send
    def recv(self):
        raw_len = self._recvl(4)
        content_len = struct.unpack('>I', raw_len)[0]
        content = self._recvl(content_len)
        return pickle.loads(content)
    def send(self, data):
        content = pickle.dumps(data)
        self._send.write(struct.pack('>I', len(content)))
        self._send.write(content)
    def _recvl(self, size):
        data = b''
        while len(data) < size:
            packet = self._recv.read(size - len(data))
            if not packet:
                raise EOFError
            data += packet
        return data
    def close(self):
        self._recv.close()
        self._send.close()

实际上,它的速度只比multiprocessing.Pipe差14倍。 (这仍然很可怕)

现在分析,在父母:

      11935 function calls (11844 primitive calls) in 1.749 seconds

Ordered by: internal time

ncalls  tottime  percall  cumtime  percall filename:lineno(function)
     2    1.385    0.692    1.385    0.692 {method 'read' of 'file' objects}
     4    0.125    0.031    0.125    0.031 {method 'decode' of 'str' objects}
     4    0.056    0.014    0.228    0.057 pickle.py:961(load_string)

在孩子身上:

      11996 function calls (11873 primitive calls) in 1.627 seconds

Ordered by: internal time

ncalls  tottime  percall  cumtime  percall filename:lineno(function)
    73    1.099    0.015    1.099    0.015 {repr}
     3    0.231    0.077    0.231    0.077 {method 'read' of 'file' objects}
     2    0.055    0.028    0.055    0.028 {method 'write' of 'file' objects}

所以,我仍然没有真正的线索,而是使用什么。

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

pickle / cPickle序列化numpy数组存在一些问题:

In [14]: timeit cPickle.dumps(numpy.random.random(1000))
1000 loops, best of 3: 727 us per loop

In [15]: timeit numpy.random.random(1000).dumps()
10000 loops, best of 3: 31.6 us per loop

问题只发生在序列化,反序列化很好:

In [16]: timeit cPickle.loads(numpy.random.random(1000).dumps())
10000 loops, best of 3: 40 us per loop

你可以使用marshal模块,巫婆甚至更快(但不安全):

In [19]: timeit marshal.loads(marshal.dumps(numpy.random.random(1000)))
10000 loops, best of 3: 29.8 us per loop

我推荐使用msgpack,但是它没有numpy的支持,而且有一个拥有它的lib很慢,反正python-msgpack不支持缓冲区也没有zerocopy功能所以它不可能有效支持numpy的。

答案 1 :(得分:0)

this answer的评论建议使用:

pickle.dump(data, file, -1)

即。将协议设置为可用的最新版本。实际上,这会使我的机器上的速度仅比multiprocessing.Pipe提高约1.7倍。使用cPickle可将此值提高到1.4左右。